Los Elementos Intercalados Cortos (SINEs) son retrotransposones eucariotas transcritos por la ARN polimerasa III (pol III). Muchos SINEs de mamíferos (T SINEs) contienen una señal de poliadenilación (AATAAA), un terminador de transcripción de pol III y una cola rica en A en su extremo 3. Los ARN de tales SINEs tienen la capacidad de poliadenilación dependiente de AAUAAA, que es única para los transcritos generados por pol III. La estructura, evolución y poliadenilación del SINE Ere de los ungulados (caballos, rinocerontes y tapires) fueron investigadas en este estudio. Un análisis bioinformático reveló la presencia de hasta ~4 x 10 copias de Ere en representantes de las tres familias. Estas copias pueden clasificarse en dos grandes subfamilias, EreA y EreB, siendo la primera distinguida por una secuencia adicional de 60 pb. El extremo 3 de numerosas copias de EreA y todas las copias de EreB exhiben una secuencia de 50 pb designada como dominio terminal (TD). La familia Ere puede subdividirse aún más en subfamilias EreA_0TD, EreA_1TD, EreB_1TD y EreB_2TD, dependiendo de la presencia y número de dominios terminales (TDs). Solo las copias EreA_0TD pueden asignarse a T SINEs ya que contienen la señal AATAAA y el terminador de transcripción TCTTT. El análisis de copias jóvenes de Ere identificadas mediante comparación con genomas de perisodáctilos relacionados reveló que EreA_0TD y, en mucho menor grado, EreB_2TD han mantenido actividad retrotransposicional en la evolución reciente de los équidos y rinocerontes. La mutagénesis dirigida y la transfección de células HeLa se utilizaron para identificar secuencias en EreA_0TD equino que son críticas para la poliadenilación de sus transcritos de pol III. Además de AATAAA y el terminador de transcripción, se encontraron dos sitios en la mitad 3 de EreA, denominados señales beta y, que son esenciales para este proceso. Se discute la evolución de Ere, con un enfoque particular en la aparición de T SINEs, así como las señales de poliadenilación en comparación con otros T SINEs.