El fitoplancton juega un papel clave en la estabilización de los ecosistemas acuáticos. Sin embargo, existe una falta de investigación sobre la estructura de las comunidades fitoplanctónicas y sus factores influyentes en lagos poco profundos en el sureste de Hubei. En este estudio, se seleccionaron cuatro lagos típicos en el verano de 2019, y se investigó la estructura de la comunidad fitoplanctónica y sus impulsores para cada lago. Los resultados mostraron que el número de especies de fitoplancton, especies dominantes, biomasa y abundancia variaban entre lagos. Una evaluación integral del índice de nivel trófico (TLI) mostró que el Lago Xiandao era oligotrófico, el Lago Baoan era ligeramente eutrófico, y el Lago Wang y el Lago Ci eran moderadamente eutróficos. Los índices de Shannon-Wiener, Margalef y Pielou mostraron que las comunidades fitoplanctónicas del Lago Wang y el Lago Ci son menos estables, y los cuerpos de agua están más severamente contaminados. En contraste, las comunidades del Lago Baoan y el Lago Xiandao son más estables y tienen una calidad de agua superior. Un análisis de redundancia (RDA) indicó que las variables principales que influyen en las estructuras de las comunidades fitoplanctónicas eran el pH y la temperatura del agua (WT) (Lago Ci); índice de permanganato (COD) y pH (Lago Xiandao); WT y nitrógeno total (TN) (Lago Wang); y WT y fósforo total (TP) (Lago Baoan).