La industria terciaria se ha convertido en la principal fuerza impulsora del desarrollo económico de China, y el ajuste y la optimización de su estructura son prerrequisitos importantes para lograr un desarrollo económico de alta calidad. Los estudios existentes se han centrado principalmente en la distribución espacial y los factores influyentes de la industria terciaria, con una exploración insuficiente de su estructura interna. En este estudio, se selecciona la aglomeración urbana del PRD como área de estudio. Sobre la base de la clasificación de la industria terciaria, se utilizan el coeficiente de Gini de Dagum, la estimación de densidad kernel y la autocorrelación espacial local para explorar la diferenciación espacial de las diversas industrias terciarias. Los factores influyentes se analizan utilizando detectores geográficos, y se proponen sugerencias para futuras estrategias de desarrollo. Los resultados muestran que, en términos de diferenciación regional, la aglomeración de diversas industrias terciarias en Guangzhou y Shenzhen es la más significativa, pero hay una insuficiente transferencia a las ciudades circundantes. En términos de estructura de desarrollo, el nivel de aglomeración de la industria terciaria consumidora es más alto, la industria terciaria pública tiende a estar más distribuida de manera uniforme, y la industria terciaria productiva es relativamente dispersa. En términos de factores influyentes, la interacción entre la población y el empleo domina la diferenciación y evolución espacial de la industria terciaria en la aglomeración urbana del PRD. Por lo tanto, en el futuro, la industria terciaria en la aglomeración urbana del PRD debería promover la optimización de la estructura industrial y el desarrollo coordinado regional bajo la guía del gobierno.