Roles potenciales de los factores de transcripción GRF en los entrenudos de sorgo durante las etapas post-reproductivas
Autores: Tu, Min; Li, Zhuang; Zhu, Yuanlin; Wang, Peng; Jia, Hongbin; Wang, Guoli; Zhou, Qin; Hua, Yuqing; Yang, Lin; Xiao, Jiangrong; Song, Guangsen; Li, Yin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Roles potenciales de los factores de transcripción GRF en los entrenudos de sorgo durante las etapas post-reproductivas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factor regulador del crecimiento
Sorgo
Factores de transcripción
Duplicación del genoma completo
Tejidos de los entrenudos
Análisis de RNA-seq
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
El factor regulador del crecimiento (GRF) es una familia de factores de transcripción específicos de las plantas, crucial para el desarrollo del meristemo y el crecimiento de las plantas. El sorgo (L. Moench) es una especie de cereal ampliamente utilizada para alimento, forraje y combustible. Aunque los tallos de sorgo son componentes importantes de biomasa, la regulación del desarrollo del tallo y la composición de carbohidratos de los tejidos del tallo siguen siendo en gran medida desconocidas. Aquí, identificamos 11 genes que codifican SbGRF y encontramos la expansión impulsada por eventos de duplicación del genoma completo. A través de análisis comparativos entre arroz y sorgo, demostramos la divergencia de los derivados de la duplicación del genoma completo (WGD). Una comparación de los perfiles de expresión de los genes apoya que los duplicados por WGD y los genes experimentaron trayectorias evolutivas distintas, lo que posiblemente condujo a funciones divergentes. El análisis de RNA-seq de los tejidos de los entrenudos identificó varios genes involucrados en la elongación de los entrenudos, la maduración y el metabolismo de la pared celular. Construimos redes de coexpresión con los datos de RNA-seq de los entrenudos de sorgo. El análisis de la red descubrió que algunos genes podrían estar involucrados en la regulación a la baja de la biosíntesis de componentes de la pared celular, mientras que otros podrían estar asociados con la regulación del aflojamiento de la pared celular, la reensamblaje y/o la biosíntesis de almidón. En resumen, nuestro análisis a nivel del genoma de los genes revela las distintas trayectorias evolutivas de los pares derivados de WGD. Es importante destacar que los análisis de expresión resaltan funciones previamente desconocidas de varios genes en la elongación de los entrenudos, la maduración y la posible participación en el metabolismo de la pared celular y el almidón durante las etapas post-anthesis.
Descripción
El factor regulador del crecimiento (GRF) es una familia de factores de transcripción específicos de las plantas, crucial para el desarrollo del meristemo y el crecimiento de las plantas. El sorgo (L. Moench) es una especie de cereal ampliamente utilizada para alimento, forraje y combustible. Aunque los tallos de sorgo son componentes importantes de biomasa, la regulación del desarrollo del tallo y la composición de carbohidratos de los tejidos del tallo siguen siendo en gran medida desconocidas. Aquí, identificamos 11 genes que codifican SbGRF y encontramos la expansión impulsada por eventos de duplicación del genoma completo. A través de análisis comparativos entre arroz y sorgo, demostramos la divergencia de los derivados de la duplicación del genoma completo (WGD). Una comparación de los perfiles de expresión de los genes apoya que los duplicados por WGD y los genes experimentaron trayectorias evolutivas distintas, lo que posiblemente condujo a funciones divergentes. El análisis de RNA-seq de los tejidos de los entrenudos identificó varios genes involucrados en la elongación de los entrenudos, la maduración y el metabolismo de la pared celular. Construimos redes de coexpresión con los datos de RNA-seq de los entrenudos de sorgo. El análisis de la red descubrió que algunos genes podrían estar involucrados en la regulación a la baja de la biosíntesis de componentes de la pared celular, mientras que otros podrían estar asociados con la regulación del aflojamiento de la pared celular, la reensamblaje y/o la biosíntesis de almidón. En resumen, nuestro análisis a nivel del genoma de los genes revela las distintas trayectorias evolutivas de los pares derivados de WGD. Es importante destacar que los análisis de expresión resaltan funciones previamente desconocidas de varios genes en la elongación de los entrenudos, la maduración y la posible participación en el metabolismo de la pared celular y el almidón durante las etapas post-anthesis.