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Roles potenciales de los factores de transcripción GRF en los entrenudos de sorgo durante las etapas post-reproductivas

Autores: Tu, Min; Li, Zhuang; Zhu, Yuanlin; Wang, Peng; Jia, Hongbin; Wang, Guoli; Zhou, Qin; Hua, Yuqing; Yang, Lin; Xiao, Jiangrong; Song, Guangsen; Li, Yin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Roles potenciales de los factores de transcripción GRF en los entrenudos de sorgo durante las etapas post-reproductivas


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Factor regulador del crecimiento
Sorgo
Factores de transcripción
Duplicación del genoma completo
Tejidos de los entrenudos
Análisis de RNA-seq

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El factor regulador del crecimiento (GRF) es una familia de factores de transcripción específicos de las plantas, crucial para el desarrollo del meristemo y el crecimiento de las plantas. El sorgo (L. Moench) es una especie de cereal ampliamente utilizada para alimento, forraje y combustible. Aunque los tallos de sorgo son componentes importantes de biomasa, la regulación del desarrollo del tallo y la composición de carbohidratos de los tejidos del tallo siguen siendo en gran medida desconocidas. Aquí, identificamos 11 genes que codifican SbGRF y encontramos la expansión impulsada por eventos de duplicación del genoma completo. A través de análisis comparativos entre arroz y sorgo, demostramos la divergencia de los derivados de la duplicación del genoma completo (WGD). Una comparación de los perfiles de expresión de los genes apoya que los duplicados por WGD y los genes experimentaron trayectorias evolutivas distintas, lo que posiblemente condujo a funciones divergentes. El análisis de RNA-seq de los tejidos de los entrenudos identificó varios genes involucrados en la elongación de los entrenudos, la maduración y el metabolismo de la pared celular. Construimos redes de coexpresión con los datos de RNA-seq de los entrenudos de sorgo. El análisis de la red descubrió que algunos genes podrían estar involucrados en la regulación a la baja de la biosíntesis de componentes de la pared celular, mientras que otros podrían estar asociados con la regulación del aflojamiento de la pared celular, la reensamblaje y/o la biosíntesis de almidón. En resumen, nuestro análisis a nivel del genoma de los genes revela las distintas trayectorias evolutivas de los pares derivados de WGD. Es importante destacar que los análisis de expresión resaltan funciones previamente desconocidas de varios genes en la elongación de los entrenudos, la maduración y la posible participación en el metabolismo de la pared celular y el almidón durante las etapas post-anthesis.

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