El objetivo principal de este documento es identificar los factores críticos de éxito (FCE) e investigar si son los mismos o no en diferentes estructuras de organización de proyectos. Las estructuras de organización bajo estudio son: funcional, por proyectos y matricial. El estudio se basa en una encuesta realizada a un gran número de proyectos de software en Jordania. Para clasificar los factores de éxito (FS) e identificar los críticos, utilizamos el índice de importancia de los FS, que se calcula en función de la probabilidad y el impacto en diferentes estructuras. Para un análisis más profundo, realizamos experimentos estadísticos con una prueba ANOVA y una prueba de correlación por rangos de Spearman. Los resultados del análisis de la prueba ANOVA indican parcialmente que los valores del índice de importancia de los FS son ligeramente diferentes entre las tres estructuras de organización. Además, los resultados de la prueba de correlación por rangos de Spearman muestran un alto grado de correlación del índice de importancia de los FS entre las estructuras de organización funcional y por proyectos, y un bajo grado de correlación entre las estructuras de organización funcional y matricial.