Objetivo: Investigar los patrones espaciales y temporales del fitoplancton en los embalses Ernestina e Itaúba, ubicados en el curso alto del río Jacuí (RS, Brasil), y su asociación con variables climáticas y limnológicas en un sistema de represas en cascada.

Métodos: Se realizaron campañas estacionales de muestreo entre enero de 2012 y febrero de 2013. En cada embalse se establecieron cuatro estaciones de muestreo, considerando tres profundidades y tres zonas distintas del reservorio: área fluvial, zona de transición y lago propiamente dicho.

Resultados: Se identificaron 91 especies de fitoplancton en el embalse Ernestina y 130 en Itaúba. No se observaron diferencias significativas en los patrones verticales ni horizontales de distribución del fitoplancton, ya que la comunidad respondió principalmente a variaciones estacionales y a las características particulares de cada embalse. A lo largo del sistema en cascada, se evidenció un aumento en la riqueza específica y en la transparencia del agua en dirección aguas abajo. Además, el tiempo de retención del agua influyó en la densidad celular y en la composición del fitoplancton.

Conclusiones: El sistema de embalses en cascada del río Jacuí mostró efectos acumulativos sobre la comunidad fitoplanctónica, destacándose una mayor riqueza específica en embalses más alejados río abajo. La integración de variables bióticas y abióticas resulta esencial para el manejo adecuado de estos sistemas complejos, dada su relevancia para la generación de energía, el abastecimiento hídrico y la gestión de cuencas.