La subfamilia SHPRH (SNF2, enlace de histonas, PHD, RING, helicasa) perteneciente al factor de remodelación de cromatina dependiente de ATP es un supresor tumoral efectivo, que puede poliubiquitinar PCNA (antígeno nuclear de células en proliferación) y participar en la reparación post-replicación en humanos. Sin embargo, se sabe poco sobre las funciones de las proteínas SHPRH en las plantas. En este estudio, identificamos un nuevo miembro de SHPRH y obtuvimos plantas transgénicas silenciadas. En contraste con las plantas tipo salvaje, las plantas transgénicas exhibieron un fenotipo de dominancia apical liberada con semi-enanismo y múltiples ramas laterales. Además, apareció una alteración global de la metilación del ADN en el tallo principal y el brote después del silenciamiento. Basado en la anotación funcional de GO (ontología genética) y el análisis de la ruta KEGG (enciclopedia de genes y genomas de Kioto), la vía de transducción de señales de hormonas vegetales se enriqueció claramente. En particular, encontramos un aumento significativo en el nivel de metilación de los genes relacionados con auxina en el tallo, mientras que los genes relacionados con auxina y citoquinina estaban hipometilados en el brote de las plantas transgénicas. Además, un análisis adicional de qRT-PCR (PCR cuantitativa en tiempo real) reveló que el nivel de metilación del ADN siempre tenía una tendencia opuesta al nivel de expresión génica. Considerando todo, nuestros hallazgos indicaron que la supresión de la expresión desencadenó la divergencia de metilación de los genes relacionados con hormonas y, posteriormente, afectó los niveles de transcripción para regular la dominancia apical en .