La antocianina es una clase de flavonoides solubles en agua que se encuentra en el bayberry chino y que no solo es responsable de la variedad de colores visibles en la naturaleza, sino que también tiene numerosos beneficios para la salud en los humanos. A través de transcriptómica comparativa, aislamos e identificamos un factor de transcripción (TF) del tipo R2R3-MYB, MrMYB9, con el fin de explorar la vía de biosíntesis de antocianinas en bayberries chinos rojos y blancos. El transcrito de MrMYB9 se correlacionó positivamente con el nivel de antocianina y la expresión de genes biosintéticos de antocianina durante la maduración del fruto del bayberry chino (valores R en el rango de 0.54-0.84, < 0.05). El análisis de secuencias reveló que MrMYB9 compartía un dominio R2R3 similar con activadores MYB de la biosíntesis de antocianinas en otras plantas. MrMYB9 transactivó sustancialmente los promotores de EBGs relacionados con la biosíntesis de antocianinas y LBGs tras la coexpresión del gen. Nuestros hallazgos indicaron que MrMYB9 puede modular positivamente la acumulación de antocianinas en el bayberry chino.