Optimización de un método para la extracción simultánea de metabolitos de oxilipinas polares y no polares, ADN, ARN, ARN pequeño y proteínas de una sola muestra de tejido pequeño
Autores: Hasegawa, Yu; Otoki, Yurika; McClorry, Shannon; Coates, Laurynne C.; Lombardi, Rachel L.; Taha, Ameer Y.; Slupsky, Carolyn M.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Optimización de un método para la extracción simultánea de metabolitos de oxilipinas polares y no polares, ADN, ARN, ARN pequeño y proteínas de una sola muestra de tejido pequeño
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Biología del tejido
Tecnologías ómicas
Tamaño de muestra
Heterogeneidad
Biomoléculas
Método de extracción
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 26
Citaciones: Sin citaciones
Una imagen más completa de la biología del tejido se puede obtener a través de la aplicación e integración de múltiples tecnologías ómicas. Sin embargo, el desafío común al trabajar con una muestra preciosa es tener una muestra demasiado pequeña para extraer por separado los analitos de interés para cada experimento. Considerando la alta heterogeneidad que puede estar presente en una muestra de tejido única, extraer todas las biomoléculas de un tejido único e indiviso es preferible porque permite la comparación directa de resultados. Aquí, combinamos un método de extracción modificado de Folch con la extracción de ADN, ARN, ARN pequeño y proteínas utilizando dos kits comerciales, lo que nos permitió extraer metabolitos polares y metabolitos oxilipínicos no polares, ADN, ARN, ARN pequeño y proteínas simultáneamente de una muestra de tejido pequeña. El método fue validado en términos de cantidad y calidad de analitos para análisis posteriores.
Descripción
Una imagen más completa de la biología del tejido se puede obtener a través de la aplicación e integración de múltiples tecnologías ómicas. Sin embargo, el desafío común al trabajar con una muestra preciosa es tener una muestra demasiado pequeña para extraer por separado los analitos de interés para cada experimento. Considerando la alta heterogeneidad que puede estar presente en una muestra de tejido única, extraer todas las biomoléculas de un tejido único e indiviso es preferible porque permite la comparación directa de resultados. Aquí, combinamos un método de extracción modificado de Folch con la extracción de ADN, ARN, ARN pequeño y proteínas utilizando dos kits comerciales, lo que nos permitió extraer metabolitos polares y metabolitos oxilipínicos no polares, ADN, ARN, ARN pequeño y proteínas simultáneamente de una muestra de tejido pequeña. El método fue validado en términos de cantidad y calidad de analitos para análisis posteriores.