Los agentes de mortalidad de semillas tras la dispersión incluyen patógenos, invertebrados y vertebrados, que pueden influir en las poblaciones y comunidades de árboles tropicales. En este estudio, evalué experimentalmente la remoción de endocarpos de Dipteryx alata tanto en el interior como en el borde de la vegetación del Cerrado. Específicamente, simulé la dispersión primaria de endocarpos por murciélagos y evalué la intensidad de la remoción secundaria según el hábitat, la estación y el número de endocarpos. Este estudio se desarrolló en el Parque Natural Municipal Pombo, un extenso remanente del Cerrado con una superficie de 9.000 ha, ubicado en el oeste de Brasil. En cada uno de los dos tipos de hábitat, establecí 45 puntos donde se colocaron pilas de D. alata de 1, 3, 7, 15 y 40 endocarpos. En promedio, la remoción de endocarpos en el interior fue mayor que en el borde, por lo que la intensidad de la remoción varió de positiva dependiente de la densidad (interior: lluvias) a negativa dependiente de la densidad (borde: ambas estaciones). Además, en ambos tipos de hábitat y estaciones, los endocarpos no removidos fueron intensamente atacados por hongos. De hecho, la mortalidad de semillas por infestación fúngica fue positivamente dependiente de la densidad. Los resultados indican una alta propensión de los endocarpos a escapar de la remoción en el borde, en principio, un área defaunada. Dado que las especies de Dipteryx dependen en gran medida de roedores caviomorfos para su dispersión, la escasez de estos vectores podría reducir las posibilidades de reclutamiento de D. alata en los remanentes del Cerrado. Esto implica cambios futuros en la estructura de la vegetación, desde el borde hacia el interior, hacia una baja diversidad arbórea.