La alta temperatura es uno de los estreses abióticos más perjudiciales en los tomates. Muchos estudios han destacado que incluso pequeños aumentos de temperatura pueden alterar el sistema reproductivo de la planta, causando una reducción significativa en el rendimiento del tomate. El objetivo de este estudio fue explotar las variaciones fenotípicas y genómicas de una colección de tomates de raza cultivada a altas temperaturas. Quince genotipos fueron seleccionados como los de mejor rendimiento en dos campos experimentales. La selección se basó en seis rasgos relacionados con el rendimiento, incluyendo precocidad de la floración, número de flores por inflorescencia, cuajado de frutos, número de frutos por planta, peso de los frutos y rendimiento por planta. Con el fin de identificar marcadores que apunten a rasgos que podrían verse altamente influenciados por condiciones climáticas adversas, como la floración y el cuajado de frutos, se llevó a cabo un enfoque de mapeo de asociación explotando un conjunto genómico de alto rendimiento de tomate. La variabilidad fenotípica observada nos permitió identificar un total de 15 marcadores comunes asociados con los rasgos estudiados. En particular, las asociaciones más relevantes se co-localizaron con genes involucrados en el desarrollo de la estructura floral, como el gen, o con genes directamente involucrados en la respuesta a estreses abióticos. Estos genes candidatos prometedores serán validados funcionalmente y transferidos a un tomate cultivado para mejorar su rendimiento bajo altas temperaturas.