Explorando los roles de la familia de genes en las respuestas al estrés por sequía en el maíz
Autores: Qian, Buxuan; Wang, Qi; Zhang, Chuang; Guo, Jia; Yu, Zhijia; Han, Jiarui; Xia, Hanchao; Zhao, Rengui; Yin, Yuejia
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Explorando los roles de la familia de genes en las respuestas al estrés por sequía en el maíz
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Familia de genes
Maíz
Estrés por sequía
árbol filogenético
Estructura génica
Análisis de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes juega un papel crucial en la regulación del crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés abiótico en las plantas. Sin embargo, se han realizado estudios limitados sobre las funciones de la familia de genes en el maíz bajo estrés por sequía. Este estudio identificó 40 miembros de la familia dentro del genoma del maíz a través de comparaciones de Blast, distribuidos de manera desigual en los primeros nueve cromosomas. El análisis de colinealidad intraespecífica reveló 13 pares vinculados. Al construir un árbol filogenético con miembros como referencia, los miembros de maíz se dividieron en dos subfamilias, KNOX y BEL1-Like, con KNOX dividido aún más en tres ramas (KNOX Clase I, KNOX Clase II y KNOX Clase III). La estructura génica y los motivos de los genes dentro de la misma subfamilia o rama mostraron similitudes, al igual que sus proteínas codificadas, que poseen motivos y dominios conservados similares. El análisis de las propiedades fisicoquímicas de las proteínas reveló que las proteínas codificadas por esta familia son estables. El análisis de la expresión de genes en maíz demostró sus roles variados en el desarrollo y la regulación del estrés por sequía, confirmados a través de qRT-PCR. La identificación, caracterización y análisis de la expresión de genes proporcionan una referencia para futuras investigaciones de funciones génicas y ayudan en la mejora genética del maíz para resistir el estrés por sequía.
Descripción
La familia de genes juega un papel crucial en la regulación del crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés abiótico en las plantas. Sin embargo, se han realizado estudios limitados sobre las funciones de la familia de genes en el maíz bajo estrés por sequía. Este estudio identificó 40 miembros de la familia dentro del genoma del maíz a través de comparaciones de Blast, distribuidos de manera desigual en los primeros nueve cromosomas. El análisis de colinealidad intraespecífica reveló 13 pares vinculados. Al construir un árbol filogenético con miembros como referencia, los miembros de maíz se dividieron en dos subfamilias, KNOX y BEL1-Like, con KNOX dividido aún más en tres ramas (KNOX Clase I, KNOX Clase II y KNOX Clase III). La estructura génica y los motivos de los genes dentro de la misma subfamilia o rama mostraron similitudes, al igual que sus proteínas codificadas, que poseen motivos y dominios conservados similares. El análisis de las propiedades fisicoquímicas de las proteínas reveló que las proteínas codificadas por esta familia son estables. El análisis de la expresión de genes en maíz demostró sus roles variados en el desarrollo y la regulación del estrés por sequía, confirmados a través de qRT-PCR. La identificación, caracterización y análisis de la expresión de genes proporcionan una referencia para futuras investigaciones de funciones génicas y ayudan en la mejora genética del maíz para resistir el estrés por sequía.