Explorando el paisaje genético del vitiligo en el caballo Pura Raza Español: una perspectiva genómica
Autores: Laseca, Nora; Molina, Antonio; Perdomo-González, Davinia; Ziadi, Chiraz; Azor, Pedro J.; Valera, Mercedes
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Explorando el paisaje genético del vitiligo en el caballo Pura Raza Español: una perspectiva genómica
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Vitiligo
Trastorno autoinmune
Melanocitos
Estudio de asociación del genoma completo
SNP
Cría selectiva
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
El vitiligo es un trastorno autoinmune de despigmentación caracterizado por la pérdida progresiva de melanocitos, lo que lleva a la aparición de despigmentación en parches de la piel. La presencia de vitiligo en caballos es mayor en aquellos con pelajes grises. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue realizar un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) para identificar regiones genómicas y posibles loci candidatos asociados con la despigmentación y susceptibilidad al vitiligo en la población de Pura Raza Español. Para este propósito, realizamos un wssGBLUP (predicción lineal mejor no sesgada de un solo paso genómico ponderado) utilizando datos de un total de 2359 animales genotipados con Affymetrix Axiom(tm) Equine 670 K y 1346 con Equine GeneSeek Genomic Profiler(tm) (GGP) Array V5. Se emplearon un total de 60,136 SNPs (polimorfismos de un solo nucleótido) presentes en los 32 cromosomas del conjunto de datos de consenso después del control de calidad para el análisis. La despigmentación similar al vitiligo fue fenotipada mediante inspección visual de las diferentes áreas afectadas (ojos, boca, fosas nasales) y se clasificó en nueve categorías con tres grados de severidad (ausente, leve y severo). Identificamos una región genómica significativa para el vitiligo alrededor de los ojos, ocho regiones genómicas significativas para el vitiligo alrededor de la boca y siete regiones genómicas significativas para el vitiligo alrededor de las fosas nasales, que explicaron el mayor porcentaje de varianza. Estas regiones genómicas significativas contenían genes candidatos relacionados con melanocitos, piel, sistema inmunológico, supresión de tumores, metástasis y carcinoma cutáneo. Estos hallazgos nos permiten implementar estrategias de cría selectiva para disminuir la incidencia de vitiligo y dilucidar la arquitectura genética subyacente al vitiligo en caballos, así como los mecanismos moleculares involucrados en el desarrollo de la enfermedad. Sin embargo, se necesitan más estudios para comprender mejor este trastorno de la piel en caballos.
Descripción
El vitiligo es un trastorno autoinmune de despigmentación caracterizado por la pérdida progresiva de melanocitos, lo que lleva a la aparición de despigmentación en parches de la piel. La presencia de vitiligo en caballos es mayor en aquellos con pelajes grises. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue realizar un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) para identificar regiones genómicas y posibles loci candidatos asociados con la despigmentación y susceptibilidad al vitiligo en la población de Pura Raza Español. Para este propósito, realizamos un wssGBLUP (predicción lineal mejor no sesgada de un solo paso genómico ponderado) utilizando datos de un total de 2359 animales genotipados con Affymetrix Axiom(tm) Equine 670 K y 1346 con Equine GeneSeek Genomic Profiler(tm) (GGP) Array V5. Se emplearon un total de 60,136 SNPs (polimorfismos de un solo nucleótido) presentes en los 32 cromosomas del conjunto de datos de consenso después del control de calidad para el análisis. La despigmentación similar al vitiligo fue fenotipada mediante inspección visual de las diferentes áreas afectadas (ojos, boca, fosas nasales) y se clasificó en nueve categorías con tres grados de severidad (ausente, leve y severo). Identificamos una región genómica significativa para el vitiligo alrededor de los ojos, ocho regiones genómicas significativas para el vitiligo alrededor de la boca y siete regiones genómicas significativas para el vitiligo alrededor de las fosas nasales, que explicaron el mayor porcentaje de varianza. Estas regiones genómicas significativas contenían genes candidatos relacionados con melanocitos, piel, sistema inmunológico, supresión de tumores, metástasis y carcinoma cutáneo. Estos hallazgos nos permiten implementar estrategias de cría selectiva para disminuir la incidencia de vitiligo y dilucidar la arquitectura genética subyacente al vitiligo en caballos, así como los mecanismos moleculares involucrados en el desarrollo de la enfermedad. Sin embargo, se necesitan más estudios para comprender mejor este trastorno de la piel en caballos.