Una exploración de pequeñas moléculas que se unen a la proteína de unión a ADN de cadena sencilla humana 1
Autores: Schuurs, Zachariah P.; Martyn, Alexander P.; Soltau, Carl P.; Beard, Sam; Shah, Esha T.; Adams, Mark N.; Croft, Laura V.; O"Byrne, Kenneth J.; Richard, Derek J.; Gandhi, Neha S.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Una exploración de pequeñas moléculas que se unen a la proteína de unión a ADN de cadena sencilla humana 1
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Dna
Hssb1
Moléculas pequeñas
Ssdna
Cáncer
Estabilidad del genoma
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
La proteína de unión a ADN de cadena sencilla humana 1 (hSSB1) es crítica para preservar la estabilidad del genoma, interactuando con el ADN de cadena sencilla (ssDNA) a través de un pliegue de unión a oligonucleótidos/oligosacáridos. La depleción de hSSB1 en modelos de líneas celulares conduce a una reparación del ADN aberrante y a una mayor sensibilidad a la irradiación. hSSB1 está sobreexpresada en varios tipos de cáncer, lo que sugiere que hSSB1 podría ser un nuevo objetivo terapéutico en enfermedades malignas. Los estudios de unión de hSSB1 se han centrado en el ADN; sin embargo, a pesar de la disponibilidad de estructuras 3D, no se han explorado pequeñas moléculas que apunten a hSSB1. Se diseñaron derivados de quinolina que apuntan a hSSB1 a través de un proceso de cribado virtual basado en fragmentos, sintetizándolos utilizando AlphaLISA y EMSA para determinar su afinidad por hSSB1. Paralelamente, se cribó una biblioteca de compuestos estructuralmente diversa contra hSSB1 utilizando los mismos ensayos bioquímicos. Se identificaron tres compuestos con afinidad nanomolar por hSSB1, exhibiendo citotoxicidad en una línea celular de osteosarcoma. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que identifica pequeñas moléculas que modulan la actividad de hSSB1. Las simulaciones de dinámica molecular indicaron que tres de los compuestos que se probaron se unieron al sitio de unión de ssDNA de hSSB1, proporcionando un marco para la elucidación adicional de los mecanismos de inhibición. Estos datos sugieren que las pequeñas moléculas pueden interrumpir la interacción entre hSSB1 y ssDNA, y también pueden afectar la capacidad de las células para reparar el daño en el ADN. Este estudio de prueba de pequeñas moléculas tiene el potencial de proporcionar información sobre preguntas bioquímicas fundamentales relacionadas con el pliegue OB.
Descripción
La proteína de unión a ADN de cadena sencilla humana 1 (hSSB1) es crítica para preservar la estabilidad del genoma, interactuando con el ADN de cadena sencilla (ssDNA) a través de un pliegue de unión a oligonucleótidos/oligosacáridos. La depleción de hSSB1 en modelos de líneas celulares conduce a una reparación del ADN aberrante y a una mayor sensibilidad a la irradiación. hSSB1 está sobreexpresada en varios tipos de cáncer, lo que sugiere que hSSB1 podría ser un nuevo objetivo terapéutico en enfermedades malignas. Los estudios de unión de hSSB1 se han centrado en el ADN; sin embargo, a pesar de la disponibilidad de estructuras 3D, no se han explorado pequeñas moléculas que apunten a hSSB1. Se diseñaron derivados de quinolina que apuntan a hSSB1 a través de un proceso de cribado virtual basado en fragmentos, sintetizándolos utilizando AlphaLISA y EMSA para determinar su afinidad por hSSB1. Paralelamente, se cribó una biblioteca de compuestos estructuralmente diversa contra hSSB1 utilizando los mismos ensayos bioquímicos. Se identificaron tres compuestos con afinidad nanomolar por hSSB1, exhibiendo citotoxicidad en una línea celular de osteosarcoma. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que identifica pequeñas moléculas que modulan la actividad de hSSB1. Las simulaciones de dinámica molecular indicaron que tres de los compuestos que se probaron se unieron al sitio de unión de ssDNA de hSSB1, proporcionando un marco para la elucidación adicional de los mecanismos de inhibición. Estos datos sugieren que las pequeñas moléculas pueden interrumpir la interacción entre hSSB1 y ssDNA, y también pueden afectar la capacidad de las células para reparar el daño en el ADN. Este estudio de prueba de pequeñas moléculas tiene el potencial de proporcionar información sobre preguntas bioquímicas fundamentales relacionadas con el pliegue OB.