Reducir las emisiones de carbono es de suma importancia para el logro de los Objetivos de Desarrollo Sostenible 2030. El efecto del comercio electrónico rural en las emisiones de carbono agrícolas (ACEs) es controvertido, y particularmente el mecanismo detrás del efecto es desconocido. Para identificar el impacto del comercio electrónico rural en las emisiones de carbono agrícolas y sus mecanismos, aprovechamos el Programa de Condado de Demostración de Comercio Electrónico Rural de China (REDCP) como un experimento cuasi natural y utilizamos el modelo de diferencia en diferencias (DID) de múltiples períodos para investigar la relación entre el comercio electrónico rural y las emisiones de carbono agrícolas. Nuestros datos se basan en datos de panel de 355 ciudades a nivel de prefectura de 2010 a 2019 en China. Identificamos que el comercio electrónico rural puede reducir las emisiones de carbono agrícolas en un promedio del 14.4%, pero este efecto no es duradero. Los análisis de mecanismos sugieren que el efecto de reducción del comercio electrónico rural en las emisiones de carbono agrícolas se debe principalmente a fomentar el crecimiento económico agrícola, aumentar la participación de la industria de bajo carbono y mejorar la productividad total de los factores agrícolas (TFP). Además, los análisis de heterogeneidad demuestran que el comercio electrónico rural tiene un mejor rendimiento en la reducción de emisiones de carbono en ciudades del este, así como en ciudades no productoras de granos principales en China.