El estudio de la embriogénesis somática puede proporcionar información sobre el desarrollo temprano de las plantas. Anteriormente obtuvimos líneas celulares embrionarias sobreexpresadas de (Lamb.) Carr. Para esclarecer aún más los mecanismos moleculares asociados con esta especie, se sometieron los perfiles transcripcionales de líneas celulares transgénicas sobreexpresadas y de tipo salvaje (WT) a secuenciación de ARN utilizando el sistema Illumina NovaSeq 6000. En total, se generaron 203,256 unigenes utilizando ensamblaje de novo de Trinity, y se obtuvieron 2467 genes expresados diferencialmente al comparar las líneas transgénicas y WT. Además, analizamos el grado de escisión de los genes objetivo en diferentes líneas celulares transgénicas al detectar el patrón de expresión de , y su grado de escisión en las líneas celulares transgénicas fue mayor que en WT. Se identificaron los genes descendentes de utilizando coeficientes de correlación de Pearson. Ensayos de levadura de un solo híbrido y de reporte de dual-luciferasa revelaron que los factores de transcripción LaHDZ31-34 podrían unirse a los promotores de , , , y . Este es el primer informe de cambios en la expresión génica causados por sobreexpresión en el alerce japonés. Estos hallazgos sientan una base para futuros estudios sobre el mecanismo regulador de miR166.