La clasificación de la familia de los plátanos (Musaceae) en tres géneros y el rango infragenérico siguen siendo ambiguos. Dentro del género, cinco secciones anteriormente separadas se fusionaron recientemente en secciones basadas en la morfología de las semillas, datos moleculares y números de cromosomas. Sin embargo, otros caracteres morfológicos clave de los géneros, secciones y especies no han sido claramente definidos. Esta investigación tiene como objetivo investigar la morfología floral masculina, clasificar a los miembros de la familia de los plátanos en función de la similitud general de los rasgos morfológicos utilizando 59 accesiones de plátano de 21 taxones y hacer inferencias sobre las relaciones evolutivas de 57 taxones basadas en ITS y secuencias de 67 Genbank y 10 accesiones de plátano recién recolectadas. Se examinaron quince caracteres cuantitativos utilizando análisis de componentes principales y análisis discriminante canónico, y 22 caracteres cualitativos fueron analizados mediante el Método de Agrupamiento por Pares No Ponderados con una Media Aritmética (UPGMA). Los resultados mostraron que la morfología de los tépalos fusionados, la forma del tépalo interno mediano y la longitud del estilo apoyaron los tres clados, mientras que las formas del tépalo interno mediano y del estigma clasificaron las dos secciones. En conclusión, una combinación de caracteres morfológicos de flores masculinas y filogenética molecular apoya bien el arreglo taxonómico dentro de la familia de los plátanos y el género, y ayuda en la selección de caracteres para construir una clave de identificación de Musaceae.