Este estudio tuvo como objetivo estimar la heterosis para rasgos productivos en un esquema de cruzamiento de dos vías. Se seleccionaron originalmente cuatro líneas de cobayas para los siguientes rasgos: la línea P1 para la tasa de crecimiento, P2 para la tasa de conversión alimenticia parcial, M1 para la tasa de crecimiento de la camada a los 10 días de edad y M2 para el tamaño de la camada al nacer. La comparación incluyó 176 animales de raza pura (P1: 46, P2: 43, M1: 54 y M2: 33) y 150 cruces (P1P2: 42, P2P1: 38, M1M2: 11 y M2M1: 59); se analizaron los pesos corporales al nacer, a los 10 días, al destete y a los 60 días de edad. Se utilizó un modelo lineal de efectos fijos, y la heterosis se estimó como la diferencia entre el rendimiento promedio de los animales cruzados y los de línea pura. Las comparaciones de líneas puras mostraron que P2 fue inferior a P1 en peso a los 10 días y peso al destete, mientras que todas las demás comparaciones entre las líneas puras paternas y maternas no fueron significativas. Los resultados indicaron efectos significativos de heterosis positiva para ambos tipos de cruces, pero solo para el peso al nacer: 3.7% para los cruces paternos y 12.7% para los cruces maternos. Las estimaciones de heterosis fueron en su mayoría positivas pero no significativas para todos los demás rasgos. Una razón para los bajos niveles de heterosis podría ser que las líneas no están muy diferenciadas genéticamente. Estos resultados sugieren que no se recomienda aplicar un esquema de cruzamiento de dos vías dentro de las líneas de cobayas paternas y maternas para la producción de carne debido a la ausencia de heterosis para los rasgos de crecimiento.