Evaluar la estructura y función de los ecosistemas de acuicultura marina es crucial para su desarrollo exitoso. En este estudio, utilizamos modelos de flujo de energía y un sistema de evaluación para medir la estructura de la red alimentaria y la capacidad de carga ecológica tanto de un ecosistema de acuicultura marina como de un sitio de control cercano. A través de esto, identificamos las especies más adecuadas para el aumento de stock y propusimos estrategias para mejorar el ecosistema de acuicultura marina. También utilizamos un modelo de red alimentaria para simular los efectos de estas estrategias. Nuestros resultados muestran que el ecosistema de acuicultura marina estaba en mejor estado que el sitio de control, lo que puede confirmar el éxito de los esfuerzos de acuicultura. Mejillones, cangrejos grandes y Scorpaenidae fueron identificados como grupos clave para el aumento, lo que podría ayudar a mejorar la salud general del ecosistema. Sin embargo, también encontramos que simplemente aumentar el número de algunas especies no es suficiente para optimizar completamente el ecosistema. Para mejorar la red alimentaria y el ecosistema en su conjunto, se necesitan estrategias más integrales, como mejorar las prácticas de protección y gestión, mejorar el diseño y despliegue de arrecifes artificiales, y aumentar la conectividad ecológica.