El mijo de escoba (L.) es un cultivo con una buena capacidad de adaptación al medio ambiente. Se han recolectado más de 8800 accesiones en el banco nacional de genes de China. La gran cantidad de germoplasmas dificultó el análisis y la evaluación. Aunque se estableció una colección central de mijo de escoba (CC) que comprende 780 accesiones, el número sigue siendo demasiado grande para que los investigadores lo exploren en profundidad. En este estudio, se analizó la diversidad genética de 634 accesiones de mijo de escoba de la colección central basada en marcadores SSR. Se extrajo una mini-colección central (MC) que contiene 256 accesiones. La mini-colección central representaba menos de la mitad de la colección central original y solo alrededor del 2.8% de los recursos totales, pero aún proporcionaba una buena representación. Además, los resultados de este estudio validaron que Shanxi es el origen del mijo de escoba, y las accesiones de la región sur pueden contener genes novedosos. En conclusión, este estudio proporciona una caracterización completa de las diversidades genéticas de la colección central de mijo de escoba en China. Además, una MC puede ayudar a seleccionar de manera razonable y eficiente materiales para la cría de mijo de escoba, ya que los investigadores podrían buscar caracteres genéticos específicos dentro de un alcance más pequeño.