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Evaluando los desempeños de los biomarcadores en un dominio restringido de alta sensibilidad

Autores: Franco, Manuel; Vivo, Juana-María

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2021

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Acceso abierto

Artículo científico
2021

Evaluando los desempeños de los biomarcadores en un dominio restringido de alta sensibilidad


Categoría

Matemáticas

Subcategoría

Matemáticas generales

Palabras clave

Avances
Biomarcadores
Bioinformática
Diagnóstico
Rendimiento
Genómico

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 30

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los avances crecientes en tecnologías de alto rendimiento han planteado un gran desafío para la identificación de nuevos biomarcadores para el diagnóstico, mediante modelos y métodos contemporáneos, a través de un análisis impulsado por la bioinformática. Los métricos de rendimiento diagnóstico como el área parcial bajo los índices muestran limitaciones para analizar datos genómicos. Entre otros problemas, la incapacidad para diferenciar entre biomarcadores cuyas curvas se cruzan entre sí con el mismo valor, la expresión inapropiada de curvas no cóncavas y la falta de una interpretación conveniente restringen su uso en la práctica. Aquí, hemos propuesto el índice de área parcial ajustada (), que es computable a través de un algoritmo válido para cualquier forma de curva, como un resumen alternativo de rendimiento para la evaluación de biomarcadores altamente sensibles. El enfoque propuesto se basa en límites superiores e inferiores de ajuste en una región de alta sensibilidad. A través de estimaciones de varianza, simulaciones y estudios de casos para el diagnóstico de leucemia, y cánceres de ovario y colon, hemos demostrado la utilidad de la métrica propuesta en términos de restablecer la interpretación y mejorar la precisión diagnóstica. Es robusto y factible incluso cuando la curva muestra ganchos, y resuelve empates de rendimiento entre biomarcadores competitivos.

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