Evaluando los desempeños de los biomarcadores en un dominio restringido de alta sensibilidad
Autores: Franco, Manuel; Vivo, Juana-María
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Evaluando los desempeños de los biomarcadores en un dominio restringido de alta sensibilidad
Categoría
Matemáticas
Subcategoría
Matemáticas generales
Palabras clave
Avances
Biomarcadores
Bioinformática
Diagnóstico
Rendimiento
Genómico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 30
Citaciones: Sin citaciones
Los avances crecientes en tecnologías de alto rendimiento han planteado un gran desafío para la identificación de nuevos biomarcadores para el diagnóstico, mediante modelos y métodos contemporáneos, a través de un análisis impulsado por la bioinformática. Los métricos de rendimiento diagnóstico como el área parcial bajo los índices muestran limitaciones para analizar datos genómicos. Entre otros problemas, la incapacidad para diferenciar entre biomarcadores cuyas curvas se cruzan entre sí con el mismo valor, la expresión inapropiada de curvas no cóncavas y la falta de una interpretación conveniente restringen su uso en la práctica. Aquí, hemos propuesto el índice de área parcial ajustada (), que es computable a través de un algoritmo válido para cualquier forma de curva, como un resumen alternativo de rendimiento para la evaluación de biomarcadores altamente sensibles. El enfoque propuesto se basa en límites superiores e inferiores de ajuste en una región de alta sensibilidad. A través de estimaciones de varianza, simulaciones y estudios de casos para el diagnóstico de leucemia, y cánceres de ovario y colon, hemos demostrado la utilidad de la métrica propuesta en términos de restablecer la interpretación y mejorar la precisión diagnóstica. Es robusto y factible incluso cuando la curva muestra ganchos, y resuelve empates de rendimiento entre biomarcadores competitivos.
Descripción
Los avances crecientes en tecnologías de alto rendimiento han planteado un gran desafío para la identificación de nuevos biomarcadores para el diagnóstico, mediante modelos y métodos contemporáneos, a través de un análisis impulsado por la bioinformática. Los métricos de rendimiento diagnóstico como el área parcial bajo los índices muestran limitaciones para analizar datos genómicos. Entre otros problemas, la incapacidad para diferenciar entre biomarcadores cuyas curvas se cruzan entre sí con el mismo valor, la expresión inapropiada de curvas no cóncavas y la falta de una interpretación conveniente restringen su uso en la práctica. Aquí, hemos propuesto el índice de área parcial ajustada (), que es computable a través de un algoritmo válido para cualquier forma de curva, como un resumen alternativo de rendimiento para la evaluación de biomarcadores altamente sensibles. El enfoque propuesto se basa en límites superiores e inferiores de ajuste en una región de alta sensibilidad. A través de estimaciones de varianza, simulaciones y estudios de casos para el diagnóstico de leucemia, y cánceres de ovario y colon, hemos demostrado la utilidad de la métrica propuesta en términos de restablecer la interpretación y mejorar la precisión diagnóstica. Es robusto y factible incluso cuando la curva muestra ganchos, y resuelve empates de rendimiento entre biomarcadores competitivos.