Los pantanos salinos proporcionan servicios ecológicos de alto valor y desempeñan un papel importante en los ecosistemas y poblaciones costeras. A medida que la tasa de aumento del nivel del mar se acelera en respuesta al cambio climático, los pantanos salinos y los entornos intermareales, así como los servicios ecosistémicos que proporcionan, podrían perderse en aquellas áreas que carecen de suministro de sedimentos para la acreción vertical o espacio para la migración hacia la tierra. Los modelos predictivos podrían desempeñar un papel importante en la previsión de esos impactos y en guiar la implementación de planes de gestión adecuados que aumenten la capacidad adaptativa de estos valiosos ecosistemas. El modelo SLAMM (modelo de afectación del nivel del mar a los pantanos) se ha utilizado ampliamente para evaluar la respuesta del hábitat de humedales costeros al aumento del nivel del mar. Sin embargo, las incertidumbres en la respuesta predicha también reflejarán la precisión y calidad de las entradas primarias, como la elevación y la cobertura del hábitat. Aquí, evaluamos el potencial de SLAMM para investigar la respuesta de los pantanos salinos atlántico-mediterráneos al futuro aumento del nivel del mar y su aplicación en esquemas de gestión. Nuestros hallazgos muestran que SLAMM es sensible a la elevación y a la resolución de los mapas de hábitat, y que la tendencia histórica del nivel del mar y las tasas de acreción de los pantanos salinos son los parámetros de entrada predominantes que influyen en la incertidumbre en las predicciones de cambio en los hábitats de los pantanos salinos. La comprensión de la evolución pasada del sistema, así como la situación contemporánea, es crucial para proporcionar distribuciones de incertidumbre precisas y, por lo tanto, establecer una línea base robusta para futuras predicciones.