Es importante evaluar con precisión la sequía agrícola debido a sus impactos nocivos en el ecosistema y la economía. Los conjuntos de datos de reanálisis de humedad del suelo proporcionan una forma importante de evaluar la sequía agrícola. En este estudio, se utilizó el conjunto de datos de humedad del suelo de superficie y subsuperficial ERA5-Land para estimar el índice de déficit de agua del suelo (SWDI) en cuatro provincias del sur de China. El conjunto de datos ERA5-Land fue evaluado con observaciones de humedad del suelo in situ de estaciones agrometeorológicas. La sequía agrícola se evaluó para tres zonas climáticas a escala semanal de 2017 a 2019 y se comparó con el déficit de agua atmosférico (AWD). Se encontró que tanto la humedad del suelo ERA5-Land como el SWDI derivado tienen una precisión relativamente alta, y el sesgo húmedo en el conjunto de datos ERA5-Land puede reducirse mediante el cálculo del SWDI. La capa subsuperficial tiene un mejor rendimiento que la capa superficial en el monitoreo de la sequía, aunque están altamente correlacionadas. Las diferentes zonas climáticas muestran diferentes períodos de sequía y severidad de la sequía, y la zona climática templada sin temporada seca tiene menos sequías. Las sequías más severas con la mayor extensión espacial ocurrieron a principios del invierno, especialmente en 2019. Las diferencias en el SWDI y AWD se muestran principalmente en el suroeste de Yunnan. Los resultados de este estudio tienen importantes valores de referencia para la gestión del riesgo de sequía.