La sequía es un estrés abiótico significativo que limita la producción de cultivos. Los frijoles de soya [ (L.) Merr.] son considerados como sensibles a la sequía. En el presente estudio, las respuestas a la sequía de accesiones de frijol de soya silvestre fueron evaluadas en diferentes etapas de crecimiento. Basado en el índice de marchitamiento de hojas de 411 accesiones en la etapa vegetativa, se identificaron siete accesiones altamente tolerantes (HT) y 24 tolerantes (T), aunque la mayoría de los frijoles de soya silvestres fueron clasificados como genotipos moderados (M), sensibles (S) y altamente sensibles (HS). Además, con frijoles de soya silvestres seleccionados, la densidad estomática disminuyó en accesiones HT pero aumentó en accesiones HS bajo condiciones de sequía en la etapa vegetativa. Sin embargo, para los frijoles de soya cultivados, la densidad estomática de los tolerantes a la sequía y los sensibles a la sequía no fue significativamente diferente entre las dos condiciones. Los niveles de expresión de factores de transcripción relacionados con la sequía indicaron que el genotipo HT mostró un nivel de expresión más alto de genes relacionados con la sequía que el genotipo HS en la etapa vegetativa. En las etapas reproductivas, 12 frijoles de soya silvestres seleccionados al azar de HT, T, S y HS basados en la evaluación en la etapa vegetativa mostraron respuestas consistentes a la sequía con rendimiento de semillas, desarrollo de raíces y estado hídrico. Sin embargo, la magnitud del efecto perjudicial de la sequía en las tasas de germinación y longitud de raíces de 165 frijoles de soya silvestres en la etapa de germinación varió dependiendo del genotipo, lo que indica que puede no haber una correlación sólida entre las mediciones fenotípicas en la etapa de germinación y las evaluaciones relacionadas con la sequía en las dos etapas de crecimiento. La información de este estudio puede proporcionar materiales de cría útiles para el desarrollo de cultivares tolerantes a la sequía a partir de frijoles de soya silvestres.