Se informan variaciones a largo plazo en la estructura poblacional, crecimiento, mortalidad, tasa de explotación y patrón de reclutamiento de dos importantes peces pelágicos pequeños comerciales (CSPFs) basadas en datos de encuestas de arrastre de fondo recolectados durante 2006-2020 en el Golfo de Beibu, Mar de China Meridional. Todos los individuos recolectados durante cada trimestre de muestreo a lo largo de un período de 15 años fueron sometidos a análisis en laboratorio. En este estudio, se evaluó la población de CSPFs que habitan el Golfo de Beibu utilizando métodos basados en la longitud (análisis de frecuencia de longitud electrónica con bootstrap (ELEFAN)) para completar la evaluación de la población en diferentes períodos de gestión pesquera (la división de los períodos de gestión pesquera se basó en la entrada y salida de China en las pesquerías costeras del Mar de China Meridional durante 15 años, específicamente divididos en período I (2006-2010), período II (2011-2015) y período III (2016-2020)). Los resultados mostraron que la longitud corporal media, el tamaño corporal dominante y la longitud asintótica estimada de dos CSPFs disminuyeron, mientras que su coeficiente de crecimiento también disminuyó, lo que indica miniaturización y un crecimiento más lento, respectivamente. Las tasas de explotación estimadas y la longitud corporal de captura para dos CSPFs indicaron que ambas poblaciones en el Golfo de Beibu estaban sobreexplotadas en el período I y moderadamente explotadas después de 2011. Estas poblaciones mostraron una buena tendencia en su estado en el período III, con la tasa de explotación mucho más baja que en el período inicial y revirtiendo la tendencia a la baja en la longitud corporal de captura. Además, las variaciones en la temporada de desove de las dos poblaciones de CSPF y su rendimiento esperado apenas satisfactorio indicaron la complejidad de la gestión pesquera actual en el Golfo de Beibu. Estos resultados sugieren que las medidas de gestión para reducir la presión pesquera pueden tener una influencia positiva en las características biológicas de esos CSPFs en el Golfo de Beibu; sin embargo, la estructura poblacional ya afectada por la sobrepesca será un gran desafío para la conservación y restauración de los recursos pesqueros en el futuro. Dado que las poblaciones actuales de CSPFs en el Golfo de Beibu aún tienen una baja longitud corporal de primera captura y una alta mortalidad por pesca (en comparación con), identificamos la necesidad de refinar la estructura poblacional controlando los esfuerzos de pesca y aumentando el tamaño capturable, y se debe prestar más atención al estado de los recursos pesqueros locales en la gestión pesquera.