El medio ambiente, la calidad del forraje, las prácticas de manejo, los patógenos y los pesticidas influyen en las respuestas de las abejas a los estresores. Este estudio propone un enfoque innovador para evaluar la salud y el rendimiento de las colonias utilizando herramientas de diagnóstico molecular al correlacionar las proteínas de hemolinfa con medidas comunes de la fuerza de la colonia, los patógenos prevalentes de las abejas (y spp.) y elementos traza esenciales (hierro, zinc y cobre). Se seleccionaron colonias de cuatro apiarios ubicados en diferentes condiciones ambientales y de forrajeo en la provincia de Bolonia (Italia). Se tomaron muestras de hemolinfa de junio a octubre de 2019. La infestación de las colonias se estimó evaluando la mortalidad natural de los ácaros, mientras que las abejas fueron analizadas en busca de esporas de spp. utilizando un método microscópico. Las proteínas de hemolinfa se cuantificaron y separaron utilizando SDS-PAGE, y el rendimiento de la colonia se evaluó determinando las abejas adultas, la cría total, la miel y las reservas de polen. Los biomarcadores medidos resultaron ser útiles para monitorear cambios en el rendimiento y las condiciones tróficas durante el verano y principios del otoño. Se encontraron correlaciones significativas entre las proteínas de hemolinfa y las medidas de rendimiento de la colonia. Una correlación positiva entre las reservas de polen, la vitelogenina y la hexamerina 70a destaca la importancia de estas proteínas para un exitoso invernaje. En octubre, la infestación se correlacionó negativamente con las proteínas totales, la vitelogenina, la apolipoforina II, la transferrina y la hexamerina 70a, con implicaciones negativas para el invernaje; además, la infestación también se correlacionó negativamente con el contenido de hierro, lo que podría afectar la homeostasis del hierro.