El anfioxo, un organismo modelo clave en la evolución de los vertebrados, es esencial para comprender el equilibrio ecológico y la diversidad de especies. Este estudio examinó la distribución espaciotemporal y evaluó la idoneidad de su hábitat en la Reserva Natural de la Costa Dorada de Changli y en las aguas costeras adyacentes desde 2008 hasta 2023 (excluyendo 2020). La abundancia máxima mostró fluctuaciones marcadas, con un fuerte descenso entre 2008 y 2015 seguido de una recuperación después de 2016, alcanzando un pico de 345 ind./m en 2022. La abundancia promedio también aumentó, alcanzando un máximo de 34 ind./m en 2022. Espacialmente, las abundancias más altas ocurrieron en estaciones centrales, mientras que los sitios periféricos fueron mucho más bajos, a veces ausentes. La correlación de Spearman y el Análisis de Componentes Principales (PCA) identificaron el tamaño de grano de sedimento (1~0.25 mm), la profundidad del agua y el sulfuro de sedimento como factores ambientales clave. Un índice de idoneidad de hábitat (HSI), construido utilizando el Proceso de Jerarquía Analítica (AHP), mostró valores más altos en estaciones centrales, indicando condiciones más favorables. Estos hallazgos destacan la importancia del monitoreo a largo plazo, aclaran los requisitos ecológicos del anfioxo y proporcionan orientación para la conservación y gestión del hábitat en regiones afectadas por el cambio ambiental y las actividades humanas.