Los programas de cría en cautiverio son cada vez más valiosos para apoyar los esfuerzos de conservación, siempre que los individuos en cautiverio sean genéticamente similares a sus contrapartes salvajes. La subespecie norteafricana del disminuido chorlitejo patinegro euroasiático, que habita en hábitats de estepa amenazados, cuenta con el apoyo de un programa de cría en cautiverio en Marruecos. Para evaluar el origen de las aves en cautiverio y su diversidad genética, comparamos los chorlitejos patinegros en cautiverio con los salvajes de Marruecos utilizando varios marcadores moleculares. Encontramos que las aves en cautiverio mostraron una baja relación y una diversidad genética similar a las poblaciones salvajes, de las cuales solo se diferenciaron por diferencias genéticas marginales. Esto confirmó los orígenes marroquíes de las aves en cautiverio, así como su idoneidad para proporcionar individuos para la liberación y el refuerzo de poblaciones salvajes. Se proporcionaron recomendaciones para mejorar la efectividad del programa de cría en la preservación de la diversidad genética y el apoyo a las poblaciones salvajes.