Las interacciones en la superficie ocurren cerca de la interfaz tierra-atmósfera, afectando así la temperatura, la convección, la capa límite y la estabilidad de la atmósfera. Una representación adecuada de las interacciones en la superficie es un componente crucial para la modelización numérica de la atmósfera y la calidad del aire. Evaluamos cuatro esquemas de superficie terrestre: 1. esquema de difusión térmica de 5 capas (1 5-Capas); 2. modelo unificado de superficie terrestre Noah (2 Noah); 3. modelo de superficie terrestre de ciclo de actualización rápida (3 RUC); y 4. modelo de superficie terrestre Pleim-Xiu (4 Pleim-Xiu) del modelo de Investigación y Pronóstico del Tiempo con Química (WRF-Chem V3.2) con el propósito de modelización atmosférica en Cuenca, que es una región con una topografía y configuración de uso del suelo complejas y que se encuentra en la región andina sur, en Ecuador. Para este propósito, modelamos las variables meteorológicas y de calidad del aire durante septiembre de 2014. Se encontró que las variables meteorológicas y de calidad del aire a corto plazo se modelaron mejor a través del esquema 2 Noah. Las variables de calidad del aire a largo plazo (promedio mensual) se modelaron mejor con las opciones 1 5-Capas y 3 RUC. En promedio, el esquema 2 Noah fue mejor para modelar la meteorología y la calidad del aire. Además, evaluamos el esquema 2 Noah combinado con el modelo de dosel urbano (UCM) (5 Noah UCM), que se desarrolló como una opción para representar los efectos urbanos a una escala subcuadrícula. Los resultados indicaron que el rendimiento del esquema 5 Noah UCM no fue mejor en la modelización que el esquema 2 Noah por sí solo. Además, el esquema 5 Noah UCM disminuyó notablemente el rendimiento de la modelización para el monóxido de carbono y las partículas finas. Estos resultados complementan evaluaciones previas de otros esquemas, lo que nos permite recomendar una configuración básica de parámetros para la modelización atmosférica en la región andina de Ecuador.