El uso de drones para monitorear poblaciones de mamíferos ha aumentado en los últimos años debido a su costo relativamente bajo, accesibilidad y capacidad para inspeccionar grandes áreas de manera rápida y eficiente. El tipo de sensor de drone utilizado durante las encuestas puede influir significativamente en la probabilidad de detección de especies. Para los mamíferos arbóreos, se utilizan comúnmente sensores de infrarrojo térmico (TIR) porque pueden detectar firmas de calor de especies que habitan en el dosel. Sin embargo, los drones equipados con cámaras TIR son más caros y, por lo tanto, menos accesibles para los profesionales de la conservación que a menudo trabajan con financiamiento limitado en comparación con los drones equipados exclusivamente con cámaras de espectro visual estándar (Rojo, Verde, Azul; drones RGB). Aunque los drones RGB pueden representar una alternativa viable de bajo costo para el monitoreo de vida silvestre, su efectividad para monitorear mamíferos arbóreos sigue siendo poco comprendida. Nuestro objetivo fue evaluar el uso de drones RGB para monitorear mamíferos arbóreos, centrándonos en los monos araña de Geoffroy (Ateles geoffroyi) y los muriquis del sur (Brachyteles arachnoides). Utilizamos vuelos preprogramados para los monos araña y vuelos manuales para los muriquis, seleccionando el método más adecuado según las características del paisaje de cada sitio de estudio; terreno plano con altura de dosel forestal relativamente homogénea y bosques montañosos con altura de dosel altamente variable, respectivamente. Detectamos monos araña en solo el 0.4% de los 232 vuelos, mientras que detectamos muriquis en el 6.2% de los 113 vuelos. Considerando que ambas especies son altamente arbóreas, utilizan el dosel superior y comparten patrones de locomoción y tamaño de grupo similares, las diferencias en la detectabilidad están más relacionadas con el tipo de vuelos de drones utilizados en cada estudio de caso que con diferencias entre especies. Los vuelos preprogramados permiten una cobertura de área sistemática y eficiente, pero limitan los ajustes en tiempo real a las condiciones ambientales como el viento, la estructura del dosel y la visibilidad. En contraste, los vuelos manuales ofrecen mayor flexibilidad, permitiendo a los pilotos ajustar la velocidad, la altura y la trayectoria del vuelo según sea necesario y pasar más tiempo sobre áreas específicas para realizar una búsqueda más exhaustiva. Esta flexibilidad probablemente contribuyó a la mayor tasa de detección observada en el estudio de los muriquis, pero la detectabilidad seguía siendo baja. Los hallazgos de los dos estudios sugieren que los drones RGB son más adecuados como una herramienta complementaria en lugar de un método principal para monitorear mamíferos arbóreos en hábitats forestales densos. No obstante, los drones RGB ofrecen oportunidades valiosas para otras aplicaciones, y destacamos varios ejemplos de su potencial utilidad en la investigación y conservación de mamíferos arbóreos.