Evaluación de la Diversidad Genética y Conservación del Germoplasma de Culter de Boca Superior en Cinco Cuencas Fluviales en China
Autores: He, Miao; Fang, Di-An; Chen, Yong-jin; Sun, Hai-bo; Luo, Hui; Ren, Ya-fei; Li, Tian-you
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Evaluación de la Diversidad Genética y Conservación del Germoplasma de Culter de Boca Superior en Cinco Cuencas Fluviales en China
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Diversidad genética
Poblaciones
Secuencias de genes mitocondriales
Diversidad de nucleótidos
Diversidad de haplotipos
Diferenciación genética
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
Para estudiar la diversidad genética de las poblaciones, analizamos la diversidad genética de cinco poblaciones del Lago Songhua (SH), el Río Huaihe (HH), el Río Changjiang (CJ), el Lago Taihu (TH) y el Lago Gehu (GH) basándonos en secuencias de genes mitocondriales. Los resultados mostraron que los contenidos promedio de las bases T, C, A y G en la secuencia de 526 pb fueron 25.3%, 18.1%, 28.1% y 28.6%, respectivamente, lo que mostró un sesgo AT. Se detectaron un total de 115 sitios polimórficos en las cinco poblaciones, y se definieron 11 haplotipos (Hap). La diversidad de nucleótidos de las cinco poblaciones varió de 0.00053 a 0.01834, y la diversidad de haplotipos varió de 0.280 a 0.746, con la mayor diversidad genética en la población TH, seguida de la población SH, con menor diversidad genética en las poblaciones HH, CJ y GH. El análisis del índice de fijación (Fst) y la distancia genética entre poblaciones mostró que hubo una diferenciación genética significativa entre la población SH y las otras poblaciones, y las distancias genéticas entre todas ellas eran grandes; la diversidad genética dentro de las poblaciones fue mayor que entre poblaciones. Las pruebas neutrales, las distribuciones de desajuste y los análisis de la trama de skyline bayesiana (BSP) mostraron que las poblaciones no han experimentado expansión poblacional y son relativamente estables en la dinámica histórica.
Descripción
Para estudiar la diversidad genética de las poblaciones, analizamos la diversidad genética de cinco poblaciones del Lago Songhua (SH), el Río Huaihe (HH), el Río Changjiang (CJ), el Lago Taihu (TH) y el Lago Gehu (GH) basándonos en secuencias de genes mitocondriales. Los resultados mostraron que los contenidos promedio de las bases T, C, A y G en la secuencia de 526 pb fueron 25.3%, 18.1%, 28.1% y 28.6%, respectivamente, lo que mostró un sesgo AT. Se detectaron un total de 115 sitios polimórficos en las cinco poblaciones, y se definieron 11 haplotipos (Hap). La diversidad de nucleótidos de las cinco poblaciones varió de 0.00053 a 0.01834, y la diversidad de haplotipos varió de 0.280 a 0.746, con la mayor diversidad genética en la población TH, seguida de la población SH, con menor diversidad genética en las poblaciones HH, CJ y GH. El análisis del índice de fijación (Fst) y la distancia genética entre poblaciones mostró que hubo una diferenciación genética significativa entre la población SH y las otras poblaciones, y las distancias genéticas entre todas ellas eran grandes; la diversidad genética dentro de las poblaciones fue mayor que entre poblaciones. Las pruebas neutrales, las distribuciones de desajuste y los análisis de la trama de skyline bayesiana (BSP) mostraron que las poblaciones no han experimentado expansión poblacional y son relativamente estables en la dinámica histórica.