(Zingiberaceae) es un cultivo medicinal y aromático bien conocido con una larga historia de cultivo en China. Las industrias alimentaria y farmacéutica utilizan ampliamente su fruto maduro seco. En este estudio, se utilizaron 12 pares de cebadores de polimorfismo amplificado anclado a promotores (PAAP) y 12 cebadores de polimorfismo derivado del ADN conservado (CDDP) para evaluar la diversidad genética y la estructura de la población de 96 accesiones de ocho poblaciones cultivadas. Se detectaron un total de 98 loci polimórficos por 12 cebadores PAAP con 8.167 loci polimórficos por cebador, y se observaron 203 loci polimórficos utilizando 12 cebadores CDDP con 16.92 alelos por cebador. La diversidad génica de Nei (PAAP, 0.207; CDDP, = 0.188) y el índice de información de Shannon (PAAP, 0.329; CDDP, = 0.305) revelaron un nivel relativamente alto de diversidad genética en estas poblaciones de . El coeficiente de diferenciación genética () para las poblaciones fue de 0.151 (PAAP) y 0.128 (CDDP), lo que indicaba que el 84.9% y el 87.2%, respectivamente, de la variación genética estaba dentro de las poblaciones. El análisis de varianza molecular (AMOVA) también reveló que la diferenciación genética de las poblaciones ocurrió principalmente dentro de las poblaciones (91% de la variación dentro de las poblaciones tanto para PAAP como para CDDP). La identidad genética entre las poblaciones investigadas fue alta para PAAP (0.957) y CDDP (0.967). El análisis de conglomerados y el análisis de coordenadas principales (PCoA) agruparon las 96 accesiones en dos grupos principales. La clasificación de las accesiones fue consistente con el análisis de la estructura de la población. En general, estos resultados serán útiles para la caracterización, conservación y utilización de los recursos de germoplasma.