El declive de la biodiversidad inducido por el ser humano ha ido en aumento durante los últimos 250 años, debido a diversas causas. Lo que es igualmente preocupante es que no somos conscientes de qué plantas están amenazadas y dónde se encuentran. Por lo tanto, estamos lejos de alcanzar el Objetivo de Biodiversidad de Aichi 2, es decir, evaluar el riesgo de extinción de la mayoría de las especies. Con ese fin, basándonos en un extenso conjunto de datos de ocurrencia, realizamos una evaluación del riesgo de extinción de acuerdo con los Criterios A y B de la UICN para todos los taxones de plantas endémicas que ocurren en Grecia, uno de los países más biodiversos de Europa, en un marco informado filogenéticamente e identificamos las áreas que necesitan priorización en la conservación. Varios de los endémicos griegos están amenazados de extinción y catorce endémicos necesitan ser priorizados, ya que son evolutivamente distintos y están en peligro a nivel global. El monte Gramos se identifica como el hotspot de conservación más importante en Grecia. Sin embargo, una parte significativa de los hotspots de conservación identificados no está incluida en ninguna área protegida designada en Grecia, lo que significa que la red de áreas protegidas griegas podría necesitar ser rediseñada al menos parcialmente. En la era del Antropoceno, donde se proyecta que el cambio climático y el uso del suelo alteren los patrones de biodiversidad y puedan forzar a muchas especies a la extinción, nuestra evaluación proporciona la línea base para futuras investigaciones en conservación, mantenimiento de servicios ecosistémicos, y podría resultar crucial para la prevención oportuna, sistemática y efectiva de extinciones de plantas en Grecia.