La interferencia de las malas hierbas representa consistentemente un desafío agronómico significativo en la producción de algodón, lo que lleva a consecuencias directas e indirectas desfavorables. En consecuencia, la estrategia predominante empleada para manejar las malas hierbas es la aplicación de herbicidas sintéticos. Sin embargo, esta dependencia extensa ha resultado en el desarrollo de poblaciones de malas hierbas resistentes a herbicidas debido al uso prolongado de un solo herbicida y la falta de rotación. Este proyecto se centró en identificar líneas de sustitución cromosómica (CS) de algodón que suprimen malas hierbas. Estas líneas CS se asemejan estrechamente al progenitor TM-1, un derivado de algodón de tierras altas. Cada línea CS lleva un solo cromosoma o brazo cromosómico intercambiado de , , o dentro del fondo de TM-1. En un experimento en invernadero utilizando un enfoque escalonado, se evaluaron cinco líneas CS, junto con dos variedades convencionales (Enlist y UA48) y la línea progenitora (TM1), para determinar su potencial para suprimir el crecimiento de amaranthus palmeri. La altura de las plantas se midió 7, 14 y 21 días después del establecimiento, y el contenido de clorofila se midió 21 días después del establecimiento. Los resultados revelaron niveles variables de reducción de clorofila en amaranthus palmeri, siendo la variedad Enlist la que mostró la menor reducción (32%) y TM-1 la que exhibió la mayor (78%). Dentro de los 14 días posteriores al establecimiento, las líneas CS T26lo, BNTN 1-15 y T11sh demostraron una supresión sustancial de la altura de amaranthus palmeri, con reducciones del 79, 70 y 71%, respectivamente. Por el contrario, Enlist mostró el rendimiento menos efectivo entre las líneas CS. Además, CS22, CS49, CS50, CS34, UA48 y CS23 mostraron una tendencia decreciente en la reducción de la altura de amaranthus palmeri de 14 a 21 días después del establecimiento. Esta investigación demuestra los atributos herbicidas inherentes dentro de las líneas CS de algodón contra amaranthus palmeri. A la luz de las aplicaciones versátiles de las fibras de algodón y las características únicas del genoma, este estudio investiga el potencial de líneas específicas de algodón para mejorar las prácticas de manejo de malas hierbas. Al esclarecer las implicaciones de nuestros hallazgos, buscamos contribuir a promover la sostenibilidad y desarrollar alternativas a los herbicidas sintéticos en los sistemas agrícolas.