Las instituciones zoológicas, como los zoológicos y acuarios, han hecho del bienestar animal una prioridad, ya que no solo es una obligación moral, sino que también es crucial para cumplir con sus roles en educación y conservación. Existe la necesidad de herramientas basadas en la ciencia para evaluar y monitorear el bienestar animal en estos entornos. Sin embargo, evaluar el bienestar de los animales en zoológicos es un desafío debido a la diversidad de especies y la falta de conocimiento sobre sus necesidades específicas. Esta revisión tiene como objetivo discutir las ventajas y desventajas de las metodologías existentes para evaluar el bienestar de los animales en zoológicos a través de: (1) Un análisis crítico de los principales enfoques para la evaluación del bienestar animal en zoológicos; (2) Una descripción de los indicadores de bienestar basados en animales más relevantes para los animales de zoológico, con un enfoque particular en los indicadores conductuales y fisiológicos; y (3) Una identificación de áreas que requieren más investigación.