Se estima que más del 95% de la agricultura orgánica se basa en variedades de cultivos que fueron criadas para el sector convencional de alto input. La mayoría de las selecciones se realizaron a través de programas de cría convencional y carecen de rasgos importantes requeridos en condiciones orgánicas y de bajo input. Los híbridos son el tipo más común de cultivares utilizados en tomate debido a la heterosis. En tomate, el autofecundado continuo permitió la homocigosidad para explotar genes aditivos favorables, lo que resulta en la llamada vigor híbrido. Este artículo presentó la posibilidad de expresar el vigor endogámico a un nivel igual o mayor que el vigor híbrido en tomate cuando se cultiva en condiciones orgánicas de bajo input. La evaluación de las líneas recombinantes producidas a través de la cría inversa clásica a partir de cuatro híbridos F de cruz simple se realizó en sistemas agrícolas de bajo y alto input. Los resultados muestran que, siguiendo el proceso de cría adecuado en la selección de generaciones tempranas y bajo condiciones de bajo input, es posible producir líneas recombinantes, demostrando vigor endogámico en el potencial de rendimiento y calidad de fruta. Estos materiales genéticos pueden servir como nuevos cultivares dinámicos destinados para el cultivo en condiciones orgánicas, de bajo input o alto input, dependiendo de su desempeño en diferentes sistemas agrícolas en las etapas posteriores de evaluación.