La acuicultura es una de las actividades de producción de proteínas con mayor potencial de desarrollo global. Es una de las que más ha crecido en los últimos años, principalmente debido a su eficiencia en la transformación de alimento en carne. Sin embargo, el aumento en la producción acuícola plantea algunas preocupaciones, especialmente en lo que respecta al uso adecuado de recursos naturales como el agua, fundamental en los sistemas de producción acuícola. Por otro lado, se han desarrollado y utilizado numerosos sistemas, modelos y técnicas de producción para gestionar recursos y reducir los impactos negativos de la actividad. Sin embargo, no se sabe cuáles sistemas de producción y prácticas de gestión son más sostenibles, aunque el desarrollo y la aplicación de estas tecnologías son cruciales e influyen profundamente en este aspecto de la producción. El emergy es un método que considera la contribución de la naturaleza y la economía en la creación del producto y el servicio, excluyendo el carácter estrictamente monetario presente en las evaluaciones económicas convencionales, siendo un modelo utilizado para medir el nivel de sostenibilidad en sistemas productivos. En este sentido, este estudio caracterizó el uso del análisis emergético en sistemas acuícolas y discutió las principales aplicaciones y usos potenciales, además de identificar la importancia del agua en la producción y mejor destino de este recurso para el desarrollo económico y sostenible de la acuicultura. La metodología de revisión sistemática identificó 17 artículos que utilizan el análisis emergético para evaluar la sostenibilidad ambiental, económica y social. Los sistemas de producción evaluados varían entre monocultivos y policultivos en diferentes niveles de producción (intensivo, semi-intensivo, extensivo). Cuando todas estas particularidades se transforman en la misma unidad (emjulio o julio solar), es posible comparar diferentes escenarios. Como recurso primario de la naturaleza, el agua merece más atención en la contabilidad emergética de los sistemas acuícolas. Se mostró la importancia de un análisis del agua más detallado considerando su uso efectivo, impacto (alteración o variación en su calidad) y flujo para un correcto análisis emergético como herramienta para promover el mantenimiento de la actividad acuícola a lo largo de los años, que tiene en el agua su mayor riqueza.