El uso de nuevas tecnologías para monitorear y evaluar la gestión de los cultivos de café permitió un aumento significativo en la productividad. La agricultura de precisión del café ha aprovechado el desarrollo de esta mercancía mediante el uso de sensores remotos y Vehículos Aéreos No Tripulados (UAVs). Sin embargo, el éxito de la agricultura de café en el país también se debió a prácticas de gestión, incluida la gestión de la cal en los suelos. Este estudio tuvo como objetivo evaluar la respuesta de plántulas de café trasplantadas a áreas sometidas a calado profundo en comparación con el calado convencional (superficial), utilizando índices de vegetación (VIs) generados por imágenes multiespectrales adquiridas mediante UAVs. El área de estudio fue sobrevolada bimensualmente por UAVs para medir la altura de la planta, el diámetro de la copa y el contenido de clorofila en el campo. Los VIs fueron generados y comparados con los datos medidos en el campo utilizando gráficos temporales lineales y un análisis de correlación. Se realizó una regresión lineal para predecir los parámetros biofísicos en función de los VIs. Se encontró una diferencia significativa solo en el contenido de clorofila. La mayoría de los índices se correlacionaron con los parámetros biofísicos, especialmente el índice de clorofila verde (GCI) y el área de copa calculada mediante vectorización. Por lo tanto, los UAVs demostraron ser herramientas efectivas de monitoreo de café y pueden ser recomendados para los productores de café.