El pepino (L.) es un cultivo hortícola importante en todo el mundo. El sodio (Na) y el cloruro (Cl) en el suelo superficial son los principales factores limitantes en las áreas costeras de la provincia de Shandong en China. Por lo tanto, para entender el mecanismo que utiliza el pepino para adaptarse al cloruro de sodio (NaCl), analizamos los indicadores fenotípicos y fisiológicos de dieciocho germoplasmas de pepino después de tres días bajo tratamiento con 100 y 150 mM de NaCl. Un análisis de conglomerados reveló que los dieciocho germoplasmas podían dividirse en cinco grupos según sus indicadores fisiológicos. Los primeros tres grupos consistieron en siete germoplasmas tolerantes a la sal y de tolerancia media a la sal, incluyendo HLT1128h, Zhenni y MC2065. Los dos grupos restantes consistieron en cinco germoplasmas de sensibilidad media a la sal, incluyendo DM26h y M1-2-h-10, y seis germoplasmas sensibles a la sal, incluyendo M1XT y 228. Un análisis de componentes principales reveló que la tendencia de las puntuaciones globales era consistente con el análisis de conglomerados segmentales y las tasas de supervivencia de las plántulas de pepino. En general, el fenotipo, la tasa de supervivencia global, el análisis de conglomerados y el análisis de componentes principales revelaron que los germoplasmas tolerantes y sensibles a la sal eran Zhenni, F11-15, MC2065, M1XT, M1-2-h-10 y DM26h. Los resultados de este estudio proporcionarán referencias para identificar o seleccionar germoplasmas de pepino tolerantes a la sal y sentar una base para la obtención de variedades de pepino tolerantes a la sal.