La diarrea sirve como un indicador de salud vital para evaluar las poblaciones de vida silvestre después de la reintroducción. Tras su liberación en la naturaleza, los animales salvajes se adaptan a diversos hábitats y patrones dietéticos. Si bien tales cambios provocan respuestas adaptativas en la microbiota fecal, también hacen que estos animales sean susceptibles a enfermedades gastrointestinales, particularmente la diarrea. Este estudio investiga las variaciones en los microorganismos fecales y los niveles hormonales entre los caballos de Przewalski afectados por diarrea y los sanos. Los resultados demuestran una reducción significativa en la diversidad alfa de la comunidad bacteriana fecal entre los caballos de Przewalski con diarrea, acompañada de alteraciones notables en la composición taxonómica. Firmicutes, Proteobacteria y Bacteroidetes emergen como filos dominantes en todas las muestras fecales, independientemente del estado de salud. Sin embargo, se observan diferencias discernibles en la abundancia bacteriana fecal entre individuos sanos y aquellos afectados por diarrea a nivel de género, específicamente, se observa una disminución en la abundancia relativa de Pseudobutyrivibrio. La mayoría de las bacterias que facilitan la síntesis de ácidos grasos de cadena corta se encuentran en los caballos de Przewalski afectados por diarrea, mientras que Erysipelotrichaceae, Phoenicibacter, Candidatus_Saccharimonas y Mogibacterium están presentes en cantidades significativamente aumentadas. Además, los niveles de inmunoglobulina IgA y cortisol están significativamente elevados en el grupo con diarrea en comparación con el grupo sin diarrea. En general, este estudio subraya cambios sustanciales en la diversidad bacteriana fecal, la abundancia y los niveles hormonales en los caballos de Przewalski durante episodios de diarrea.