Evaluación de la Diversidad Genética y Estructura Poblacional de Blume (Rhizophoraceae) en Tailandia
Autores: Ruang-areerate, Panthita; Naktang, Chaiwat; Kongkachana, Wasitthee; Sangsrakru, Duangjai; Narong, Nattapol; Maknual, Chatree; Pravinvongvuthi, Tamanai; Promchoo, Waratthaya; Yamprasai, Suchart; Tangphatsornruang, Sithichoke; Pootakham, Wirulda
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Evaluación de la Diversidad Genética y Estructura Poblacional de Blume (Rhizophoraceae) en Tailandia
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Manglar
Variación genética
Secuencia del genoma
SNP
Diversidad genética
Estructura poblacional
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
es uno de los árboles de manglar más extendidos y económicamente importantes en la región del Indo-Oeste del Pacífico. El conocimiento de la variación genética de en Tailandia es limitado. Aquí, generamos una secuencia de genoma completo utilizando la tecnología 10x Genomics. La ensambladura del genoma fue de 230.47 Mb. Basado en su genoma, se identificaron 2640 loci de SNPs bialélicos de alta calidad de 82 accesiones recolectadas de 17 bosques de manglares naturales en Tailandia para evaluar la diversidad genética y la estructura poblacional entre ellos. Se observó un nivel moderado de diversidad genética de . La heterocigosidad observada promedio (o = 0.48) fue mayor que la heterocigosidad esperada promedio (e = 0.36). Se observaron y confirmaron dos subpoblaciones a partir de tres enfoques: estructura poblacional, PCA y análisis filogenéticos. Correspondían al Golfo de Tailandia y al Mar de Andamán, separados por la Península de Malaca. Los análisis de AMOVA indicaron que la variación genética se atribuía al 76.22% dentro de las poblaciones y al 23.78% entre poblaciones. Se observó un alto nivel de diferenciación genética entre las dos subpoblaciones ( = 0.24, < 0.001). Este estudio evaluó la diversidad genética y la estructura poblacional de , proporcionando información útil para la gestión sostenible de los manglares en Tailandia.
Descripción
es uno de los árboles de manglar más extendidos y económicamente importantes en la región del Indo-Oeste del Pacífico. El conocimiento de la variación genética de en Tailandia es limitado. Aquí, generamos una secuencia de genoma completo utilizando la tecnología 10x Genomics. La ensambladura del genoma fue de 230.47 Mb. Basado en su genoma, se identificaron 2640 loci de SNPs bialélicos de alta calidad de 82 accesiones recolectadas de 17 bosques de manglares naturales en Tailandia para evaluar la diversidad genética y la estructura poblacional entre ellos. Se observó un nivel moderado de diversidad genética de . La heterocigosidad observada promedio (o = 0.48) fue mayor que la heterocigosidad esperada promedio (e = 0.36). Se observaron y confirmaron dos subpoblaciones a partir de tres enfoques: estructura poblacional, PCA y análisis filogenéticos. Correspondían al Golfo de Tailandia y al Mar de Andamán, separados por la Península de Malaca. Los análisis de AMOVA indicaron que la variación genética se atribuía al 76.22% dentro de las poblaciones y al 23.78% entre poblaciones. Se observó un alto nivel de diferenciación genética entre las dos subpoblaciones ( = 0.24, < 0.001). Este estudio evaluó la diversidad genética y la estructura poblacional de , proporcionando información útil para la gestión sostenible de los manglares en Tailandia.