Se realiza un análisis de las características cualitativas y propiedades químicas de 32 cultivares de duraznos (frutas de pulpa amarilla y blanca) y 52 cultivares de nectarinas (frutas de pulpa amarilla y blanca) de diferentes características pomológicas, y se analiza la correlación entre cultivares y características químicas. Las nectarinas amarillas presentan una mayor variabilidad en la concentración de sólidos solubles (SSC) y los valores de acidez titulable (TA). La evaluación de los parámetros de color (a*, b*, L*) muestra una interacción significativa entre el color de la pulpa (blanco vs. amarillo) y los tipos (duraznos vs. nectarinas) de fruta. La diferencia entre las frutas amarillas y blancas es más fuerte en las nectarinas que en los duraznos. La sacarosa es el principal azúcar detectado en las frutas de durazno, con un contenido porcentual del 78.37% y 76.70% del contenido total de azúcares en duraznos amarillos y blancos, respectivamente, y 78.29% y 78.12% en nectarinas amarillas y blancas, respectivamente. Se encuentra variabilidad entre los cultivares para los compuestos químicos analizados. La pulpa amarilla tiene mayores cantidades de carotenoides totales y TPC, mientras que las frutas de pulpa blanca presentan un valor antioxidante promedio superior al de las frutas de pulpa amarilla. No se encuentra una correlación significativa para el contenido de polifenoles y DPPH, mientras que se evidencia una interacción (< 0.005) entre el contenido de ácido neoclorogénico y los duraznos y nectarinas, con un contenido de ácido neoclorogénico mayor en las nectarinas que en los duraznos.