Evaluación de Herramientas Computacionales para Predecir Sintones Supramoleculares
Autores: Sandhu, Bhupinder; McLean, Ann; Sinha, Abhijeet S.; Desper, John; Aakery, Christer B.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Evaluación de Herramientas Computacionales para Predecir Sintones Supramoleculares
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Química
Palabras clave
Sintones supramoleculares
Estructura cristalina
Sitios de reconocimiento molecular
Energías de enlace de hidrógeno
Propensión al enlace de hidrógeno
Coordinación de enlaces de hidrógeno
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
La capacidad de predecir los sin tonos supramoleculares más probables en un sólido cristalino es un punto de partida valioso para predecir posteriormente la estructura cristalina completa de una molécula con múltiples sitios de reconocimiento molecular en competencia. Se aplicaron modelos de predicción basados en energía e informática, basados en potenciales electrostáticos moleculares (PEMs), energías de enlace de hidrógeno (EBH), propensión al enlace de hidrógeno (PEH) y coordinación de enlace de hidrógeno (CEH) a las estructuras cristalinas de doce moléculas basadas en pirazol. La EBH, el método más exitoso, predijo correctamente el 100% de las interacciones intermoleculares primarias observadas experimentalmente, seguido por PEH (87.5%) y CEH = PEMs (62.5%). Un análisis adicional de CEH sugirió un riesgo de cruce de sin tonos y polimorfismo de sin tonos en moléculas con múltiples sitios de unión. Estos modelos fáciles de usar (basados solo en la estructura química 2-D) pueden ofrecer una valiosa evaluación de riesgos de posibles desafíos de formulación.
Descripción
La capacidad de predecir los sin tonos supramoleculares más probables en un sólido cristalino es un punto de partida valioso para predecir posteriormente la estructura cristalina completa de una molécula con múltiples sitios de reconocimiento molecular en competencia. Se aplicaron modelos de predicción basados en energía e informática, basados en potenciales electrostáticos moleculares (PEMs), energías de enlace de hidrógeno (EBH), propensión al enlace de hidrógeno (PEH) y coordinación de enlace de hidrógeno (CEH) a las estructuras cristalinas de doce moléculas basadas en pirazol. La EBH, el método más exitoso, predijo correctamente el 100% de las interacciones intermoleculares primarias observadas experimentalmente, seguido por PEH (87.5%) y CEH = PEMs (62.5%). Un análisis adicional de CEH sugirió un riesgo de cruce de sin tonos y polimorfismo de sin tonos en moléculas con múltiples sitios de unión. Estos modelos fáciles de usar (basados solo en la estructura química 2-D) pueden ofrecer una valiosa evaluación de riesgos de posibles desafíos de formulación.