Los bovinos Dehong de joroba son recursos ganaderos valiosos de la provincia de Yunnan, China; tienen rasgos típicos de cebú. Aquí, investigamos sus características genéticas utilizando datos de resecuenciación del genoma completo de animales Dehong de joroba (n = 18). Al comparar nuestros datos con los datos disponibles públicamente, encontramos que los bovinos Dehong de joroba tienen una alta diversidad de nucleótidos. Basado en modelos de agrupamiento en un análisis de estructura poblacional, los bovinos Dehong de joroba tenían un ancestro genómico común con el ganado indicino chino e indio. Al utilizar el método RFMix, se especula que los tamaños corporales de los bovinos Dehong de joroba fueron influenciados por los segmentos indicinos chinos y que los sistemas inmunológicos de los bovinos Dehong de joroba fueron afectados por segmentos ancestrales adicionales (indicino indio). Además, exploramos las regiones de selección de posición que albergan genes en los bovinos Dehong de joroba, que estaban relacionados con la tolerancia al calor y las respuestas inmunitarias. Notablemente, se detectaron mutaciones missense en el gen candidato (c.870C>A p.Asp290Glu; c.987C>A p.Ser329Arg). Las mutaciones missense pueden tener implicaciones para la adaptación de los bovinos Dehong de joroba a ambientes cálidos. Este estudio proporciona valiosos datos de recursos genómicos a nivel del genoma completo y allana el camino para futuros trabajos de cría genética en los bovinos Dehong de joroba.