El propósito de este experimento fue evaluar los cambios en la calidad de fermentación, la composición química, la estabilidad aeróbica, los factores antinutricionales y las características de desaparición in situ de varias raciones totales mezcladas a base de proteínas. Se utilizaron harina de soja (control, no fermentada), harina de semilla de algodón fermentada (F-CSM) y harina de semilla de colza fermentada (F-RSM) para preparar las raciones con maíz, silo de maíz de planta entera, tallos de maíz, salvado de trigo y premix. Los grupos de prueba se inocularon al 50% de humedad y se almacenaron de manera aeróbica durante 60 horas. Se utilizó el método de bolsa de nailon para medir y estudiar la degradación de nutrientes en el rumen. El pH de todas las raciones después de 48 horas de exposición al aire fue inferior a 4.8, mientras que el de los grupos F-CSM y control y F-RSM aumentó a 5.0 y >7.0, respectivamente. Después de 8 horas de exposición aeróbica, las temperaturas de todos los grupos aumentaron significativamente, y 56 horas después, estaban 2 grados Celsius por encima del aire circundante. La concentración de ácido láctico en los grupos F-CSM y F-RSM aumentó después de 12 horas de exposición aeróbica y luego disminuyó. Las concentraciones de ácido acético en los grupos fermentados disminuyeron significativamente con el aumento del tiempo de exposición al aire. La población de levaduras de las raciones aumentó a más de 8.0 log CFU/g antes de las 72 horas de exposición al aire, seguida de una disminución en la población (5.0 log CFU/g). Después de la fermentación, la concentración de gossypol libre (FG) en F-CSM disminuyó a la mitad y no cambió significativamente durante el período de exposición al aire. La fermentación con probióticos también redujo la concentración de glucosinolatos en F-RSM, resultando en una tasa de desintoxicación de más del 50%. En comparación con los grupos F-CSM y F-RSM, las tasas de degradación efectiva de nutrientes en el grupo control fueron las más bajas, y la materia seca (DM), proteína cruda (CP), fibra detergente natural (NDF) y fibra detergente ácida (ADF) se degradaron efectivamente a tasas de 28.4%, 34.5%, 27.8% y 22.8%, respectivamente. La fermentación con probióticos podría mejorar la calidad de fermentación y la composición de nutrientes, disminuir el factor antinutricional y aumentar la degradación de nutrientes de la ración total mezclada con harina de semilla de algodón o harina de semilla de colza como fuente principal de proteínas, logrando así la desintoxicación.