El desarrollo rural sostenible es esencial para mantener comunidades locales activas y evitar la despoblación y la degradación de las áreas rurales. Es necesario realizar una evaluación adecuada del desarrollo en estos territorios para mejorar la toma de decisiones e informar la política pública, al tiempo que se asegura la conservación de la biodiversidad y el suministro de servicios ecosistémicos. Las áreas rurales incluyen sistemas de alto valor ecológico, pero la vulnerabilidad de los componentes ambientales en los indicadores de desarrollo no ha sido suficientemente identificada. El objetivo principal de este trabajo fue proponer un nuevo indicador compuesto de desarrollo rural sostenible (nSRDI) considerando un indicador de dimensión ambiental basado en la vulnerabilidad de los servicios ecosistémicos y los indicadores de dimensiones social y económica establecidos utilizando un modelo de Análisis de Envoltura de Datos (DEA) con Beneficio de la Duda (BoD) de forma secuencial. También se buscó probar los efectos de los métodos de ponderación en el nSRDI. El indicador compuesto se aplicó a 10 regiones (comarcas) en la provincia de Huesca, España, produciendo un ranking de regiones en consecuencia. El indicador fue probado además a través del análisis del efecto de un método de ponderación igual y óptimo en las puntuaciones y clasificaciones de las regiones. Los resultados mostraron diferencias sustanciales en las puntuaciones/clasificaciones del nSRDI cuando se añadió la vulnerabilidad al proceso, sugiriendo que la dimensión ambiental y la perspectiva desde la cual se concibe y aplica son importantes al abordar el desarrollo rural sostenible.