(1) Antecedentes. Se realizó una extensa encuesta de cultivos de cobertura sembrados con vides y flora de malezas espontáneas desde 2019 hasta 2020 en viñedos orgánicos en seis países europeos (Francia, Italia, Rumania, Eslovenia, España, Suiza). Nuestro objetivo principal fue detectar e identificar la presencia de especies de morfos asexuales similares asociadas con la enfermedad de pie negro en sus raíces. (2) Métodos. Se realizaron aislamientos fúngicos de fragmentos de raíces en medios de cultivo. Las especies de morfos asexuales similares se identificaron analizando los datos de secuencia de ADN de la región del gen de histona H3. En total, se analizaron 685 plantas pertenecientes a diferentes familias y géneros botánicos. Se recuperaron morfos asexuales similares de 68 plantas (9.9% del total) y aproximadamente el 0.97% de los fragmentos de raíces sembrados. (3) Resultados. Se identificaron tres especies fúngicas. fue la más frecuente y se aisló de muchas especies de cultivos de cobertura en los seis países. Un análisis de componentes principales con las variables del viñedo mostró que las temperaturas estacionales y el contenido de materia orgánica del suelo se correlacionaron positivamente con la incidencia de morfos asexuales similares. (4) Conclusiones. La presencia de morfos asexuales similares en las raíces de los cultivos de cobertura sugiere que pueden actuar potencialmente como hospedadores alternativos para la supervivencia a largo plazo o para aumentar los niveles de inóculo en los suelos de los viñedos.