El tomate es uno de los frutos hortalizas más consumidos a nivel mundial y es una fuente dietética importante de minerales, fibra, carotenoides y vitamina C. El tomate también es conocido por su contenido químico nutracéutico que fortalece los sistemas inmunitarios humanos y protege contra enfermedades infecciosas y degenerativas. Por esta razón, recientemente se ha puesto énfasis en criar nuevos cultivares de tomate con valor nutracéutico. La mayoría de los cultivares modernos de tomate son híbridos F, y muchas de las características asociadas con la calidad de la fruta tienen una acción génica aditiva; por lo tanto, en teoría, el vigor híbrido podría alcanzar el vigor de los inbred. Un total de 20 líneas recombinantes fueron liberadas de los híbridos comerciales de cruce simple Iron, Sahara, Formula y Elpida, a través de un proceso de cría. Esas líneas recombinantes fueron evaluadas durante primavera-verano de 2015 en condiciones de cultivo orgánico en un diseño experimental de bloques completos al azar (RCBD) con tres repeticiones. Un total de once características cualitativas de la fruta fueron registradas en base a plantas individuales. Los resultados de este estudio indicaron que la selección simultánea de plantas individuales de tomate, tanto en términos de su alto rendimiento como de las características deseadas de calidad de la fruta, puede llevar a líneas recombinantes altamente productivas con características de calidad integradas. Por lo tanto, el vigor inbred puede alcanzar e incluso superar el vigor híbrido. La respuesta a la selección de todas las características evaluadas muestra una acción génica aditiva de todas las características medidas. Estas líneas recombinantes pueden cumplir este papel como alternativas a los cultivares híbridos y aquellos que poseen altos valores nutricionales para funcionar como alimentos funcionales-protectores.