Una evaluación basada en citometría de flujo del tamaño genómico y el nivel de ploidía de especies silvestres en India
Autores: Natarajan, Rithesh B.; Pathania, Pooja; Singh, Hardeep; Agrawal, Anuradha; Subramani, Rajkumar
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Una evaluación basada en citometría de flujo del tamaño genómico y el nivel de ploidía de especies silvestres en India
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Variación en el tamaño del genoma
Estudios evolutivos
Nivel de ploidía
Citometría de flujo
Número de cromosomas
Caracterización taxonómica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
La variación en el tamaño del genoma es un atributo importante en la caracterización evolutiva y de especies. L. se considera uno de los géneros taxonómicamente complicados dentro del orden Zingiberales, con más de 75 especies que van desde cultivares con semillas silvestres hasta sin semillas, que pueden ser diploides, triploides o tetraploides. El conocimiento del contenido total de ADN nuclear en términos de tamaño del genoma y nivel de ploidía en especies silvestres es absolutamente importante en estudios evolutivos y genómicos. Métodos: En este trabajo, se realizó la dispersión de cromosomas mediante la aislamiento de protoplastos y se utilizó un método rápido de secado al aire y citometría de flujo con L. (Brassicaceae) como estándar para la estimación de ploidía y tamaño del genoma. Resultados: Los resultados mostraron que el tamaño del genoma (2C) variaba entre especies, basado en la relación de las posiciones de los picos G1. El tamaño del genoma más bajo (2C) se encontró en var. (1.051 +/- 0.060 pg) y el tamaño del genoma más alto (2C) se registró para ABB.cv. Meitei-hei (1.812 +/- 0.108 pg) para la sección. Entre las especies que pertenecen a la sección, tuvo el contenido 2C más bajo de 1.194 +/- 0.033 pg, mientras que el contenido de ADN nuclear más alto (2C) se observó en (1.488 +/- 0.203 pg). El análisis cito-genético reveló que el número de cromosomas de 14 especies silvestres era 2n = 22, mientras que 1 especie mostró un número de cromosomas de 2n = 18 (diploide), y para 3 especies, el número de cromosomas fue 2n = 33 (triploides). Un estudio de asociación basado en el coeficiente de correlación de Pearson mostró que el contenido de ADN nuclear 2C era significativo y estaba positivamente correlacionado con el nivel de ploidía (R = 0.9) y el número de cromosomas (R = 0.84). Conclusiones: El presente estudio proporciona información confiable sobre el tamaño del genoma y el nivel de ploidía de especies silvestres de la región india a través de análisis citométricos de flujo, que podrían ser utilizados en programas de mejora taxonómica y de cultivos. Por primera vez, se estimó y reportó el contenido de ADN nuclear de ocho especies silvestres diploides y tres triploides de India. El tamaño del genoma podría ser un indicador efectivo en la identificación de especies y estudios evolutivos con diferentes niveles de ploidía y similitudes morfológicas.
Descripción
La variación en el tamaño del genoma es un atributo importante en la caracterización evolutiva y de especies. L. se considera uno de los géneros taxonómicamente complicados dentro del orden Zingiberales, con más de 75 especies que van desde cultivares con semillas silvestres hasta sin semillas, que pueden ser diploides, triploides o tetraploides. El conocimiento del contenido total de ADN nuclear en términos de tamaño del genoma y nivel de ploidía en especies silvestres es absolutamente importante en estudios evolutivos y genómicos. Métodos: En este trabajo, se realizó la dispersión de cromosomas mediante la aislamiento de protoplastos y se utilizó un método rápido de secado al aire y citometría de flujo con L. (Brassicaceae) como estándar para la estimación de ploidía y tamaño del genoma. Resultados: Los resultados mostraron que el tamaño del genoma (2C) variaba entre especies, basado en la relación de las posiciones de los picos G1. El tamaño del genoma más bajo (2C) se encontró en var. (1.051 +/- 0.060 pg) y el tamaño del genoma más alto (2C) se registró para ABB.cv. Meitei-hei (1.812 +/- 0.108 pg) para la sección. Entre las especies que pertenecen a la sección, tuvo el contenido 2C más bajo de 1.194 +/- 0.033 pg, mientras que el contenido de ADN nuclear más alto (2C) se observó en (1.488 +/- 0.203 pg). El análisis cito-genético reveló que el número de cromosomas de 14 especies silvestres era 2n = 22, mientras que 1 especie mostró un número de cromosomas de 2n = 18 (diploide), y para 3 especies, el número de cromosomas fue 2n = 33 (triploides). Un estudio de asociación basado en el coeficiente de correlación de Pearson mostró que el contenido de ADN nuclear 2C era significativo y estaba positivamente correlacionado con el nivel de ploidía (R = 0.9) y el número de cromosomas (R = 0.84). Conclusiones: El presente estudio proporciona información confiable sobre el tamaño del genoma y el nivel de ploidía de especies silvestres de la región india a través de análisis citométricos de flujo, que podrían ser utilizados en programas de mejora taxonómica y de cultivos. Por primera vez, se estimó y reportó el contenido de ADN nuclear de ocho especies silvestres diploides y tres triploides de India. El tamaño del genoma podría ser un indicador efectivo en la identificación de especies y estudios evolutivos con diferentes niveles de ploidía y similitudes morfológicas.