(1) Antecedentes: El diagnóstico temprano del queratocono es crucial para el pronóstico. Métodos tradicionales como ORA y Corvis ST miden la biomecánica corneal general pero carecen de especificidad regional y se ven afectados por la presión intraocular. En contraste, la microscopía de Brillouin evalúa la biomecánica corneal regional sin tales limitaciones; (2) Métodos: En total, 25 pacientes con queratocono y 28 controles sanos fueron incluidos en este estudio. La biomecánica corneal se midió utilizando el sistema BOSS (Sistema de Escaneo Óptico de Brillouin) en un modo de 10 puntos dentro de un diámetro de 8 mm e incluyó el cambio de Brillouin promedio, máximo, mínimo y estándar. Los parámetros extraídos de Corvis ST incluyeron el CBI (Índice Biomecánico Corneal), CCBI (Índice Biomecánico Corneal de poblaciones chinas), SSI (Índice de Esfuerzo-Deformación), DA (Amplitud de Deformación), IIR (Radio Integrado Inverso) y SP-A1 (Parámetro de Rigidez en el Primer Aplanamiento); (3) Resultados: BOSS mostró diferencias significativas en la región nasal inferior ( = 0.004) y región central ( = 0.029) entre los grupos, pero no en regiones periféricas ( = 0.781). En una comparación de los cambios de frecuencia de Brillouin medidos entre los grupos, no hubo diferencia en el Promedio ( = 0.452) y Máx ( = 0.487), pero el Mínimo ( = 0.003), Estándar ( = 0.000), y Máx-Mín ( = 0.006) mostraron diferencias. Corvis ST identificó diferencias significativas en seis parámetros (CBI, CCBI, SSI, DA, IIR y SP-A1) entre los grupos ( < 0.001). Se encontraron correlaciones entre los resultados de BOSS y Corvis ST, con correlaciones moderadas en la región nasal inferior; (4) Conclusiones: El microscopio Brillouin BOSS puede proporcionar una evaluación diagnóstica precisa de las diferencias biomecánicas corneales entre ojos normales y queratocono, independientemente de la PIO (Presión Intraocular) y el CCT (Grosor Corneal Central), con una buena correlación con Corvis ST, especialmente en la evaluación de la biomecánica regional.